Регистрация / Вход
Прислать материал

Разработка тест-системы для выявления и анализа лекарственной устойчивости инфекционных агентов, приводящих к нарушениям репродуктивных функций.

Докладчик: Кубанов Алексей Алексеевич

Должность: заместитель директора, профессор, доктор медицинских наук

Цель проекта:
1. Повышение качества клинической лабораторной диагностики инфекций, передаваемых половым путём, условно-патогенных микроорганизмов. Назначение патогенетической терапии с учётом данных по резистентности к применяемым антимикробным препаратам Число вновь выявленных случаев заболеваний ИППП в Российской Федерации в 2013 году составило 333852, что соответствует интенсивному показателю 233,4 на 100 тысяч населения. 2. Разработка тест-системы на основе ДНК-чипов для идентификации возбудителей инфекций, приводящих к нарушению репродуктивных функций, с одновременным определением генетических детерминант устойчивости к спектру антимикробных препаратов.

Основные планируемые результаты проекта:
1. Предлагаемый к разработке метод и тест-система на его основе должны обеспечить идентификацию одновременно не менее 15 наиболее актуальных патогенов и не менее 30 молекулярных детерминант устойчивости к широкому спектру антимикробных препаратов. Данный подход, реализованный с использованием ДНК-чипа, является мультиплексным, что даст возможность обнаружить как патогенные микроорганизмы, вызвавшие заболевание (в том числе при сочетанном поражении урогенитального тракта), так и ключевые мутации, приводящие к устойчивости.
2. Создание тест-системы на основе предлагаемого к разработке метода позволит проводить персонализированную терапию больных, основанную на рациональном назначении химиопрепаратов, значительно уменьшить количество осложнений и неудач терапии воспалительных заболеваний урогенитального тракта, обусловленных микроорганизмами, устойчивыми к антимикробным препаратам.
3.4 Молекулярно-биологические методы, основанные на амплификации нуклеиновых кислот, являются высокочувствительными и специфичными (98-100%), однако на чувствительность исследования могут влиять различные ингибирующие факторы, вследствие которых возможны ложноотрицательные результаты. К недостаткам этого метода можно отнести большую требовательность к чистоте используемых реагентов, на результаты ПЦР также оказывает влияние метод выделения ДНК из биообразцов.
Помимо непосредственного выявления возбудителей ИПНРФ в клинических образцах, большое значение имеет определение чувствительности микроорганизмов к антимикробным препаратам. В настоящее время во всем мире отмечается рост устойчивости инфекционных агентов к антимикробным препаратам, что вызывает значительные затруднения при выборе методов лечения пациентов.
Методы, основанные на фенотипическом определении устойчивости к антибиотикам, требуют стадии культивирования микроорганизма, что занимает более 24 часов. Методы генетической идентификации маркеров резистентности позволяют непосредственно выявлять наличие у выделенных микроорганизмов генов, отвечающих за формирование резистентности к антибактериальному препарату и/или мутаций, приводящих к развитию устойчивости.
В последние 5 лет представлено немалое количество разработок методов одновременной идентификации возбудителей ИПНРФ, основанных на амплификации и/или гибридизации нуклеиновых кислот Для одновременной идентификации нескольких возбудителей ИПНРФ предложено несколько вариантов мультиплексных тест-систем на основе ПЦР в реальном времени и гибридизационных технологий, как в виде научных разработок, так и коммерческих диагностикумов. Однако, ни один из существующих тестов не предусматривает одновременное установление генетических детерминант устойчивости к широкому спектру антимикробных препаратов.
5.С целью подтверждения характеристик тест-системы в режиме валидации будут проведены лабораторные испытания макетов с использованием созданной в ходе проекта коллекции клинических образов и изолятов в количестве не менее 300 ед., охарактеризованных микробиологическими, биохимическими и молекулярно-генетическими методиками.
Макет тест-системы будет апробирован в ходе клинико-лабораторных испытаний спектра микроорганизмов – возбудителей ИПНРФ, циркулирующих на территории РФ, в ходе которых в режиме скрининга должно быть проведено генотипирование исследуемых возбудителей по анализируемым локусам – детерминантам лекарственной устойчивости.

Назначение и область применения, эффекты от внедрения результатов проекта:
1. Области применения – медицина (практическое здравоохранение), в том числе дерматовенерология, акушерство и гинекология, урология, клиническая лабораторная диагностика, эпидемиология.
2. Практическое внедрение - учреждений дерматовенерологического профиля Российской Федерации, включая сеть кожно-венерологических диспансеров субъектов Российской Федерации (159 в 2013 году), центры акушества и гинекологии, родильные дома, федеральные медицинские центры Министерства здравоохранения РФ, государственные и частные лаборатории, выполняющие анализы in vitro.
3. Переход клинико-диагностических лабораторий практического здравоохранения на унифицированные и автоматизированные методы, исключающие субъективные факторы на этапе постановке диагноза.

Текущие результаты проекта:
1. Выполнение 1 этапа