Регистрация / Вход
Прислать материал

Разработка ускоренной системы идентификации возбудителей внутрибольничных инфекций с одновременным определением их лекарственной устойчивости на основе ДНК-чипов

Докладчик: Маянский Николай Андреевич

Должность: Заведующий лабораторным отделом

Цель проекта:
Идентификация возбудителя, вызвавшего инфекционное заболевание, и установление генетических детерминант устойчивости к антимикробным препаратам с целью назначения адекватного индивидуального режима терапии являются основами персонализированной медицины. Предлагаемая к разработке комплексная тест-система для диагностики инфекционных агентов должна быть основана на многопараметрическом анализе последовательностей ДНК, позволяющих в едином реакционном объеме тестировать десятки и сотни фрагментов генома на предмет выявления нуклеотидных последовательностей, специфичных для конкретного возбудителя и выявляющих генетические детерминанты устойчивости к широкому спектру препаратов. Оптимальной платформой создания таких комплексных тест-систем для многопараметрического анализа образцов ДНК является технология биочипов, которая позволяет анализировать в многопараметрическом формате сотни образцов в день. Таким образом, целью проекта является разработка макета тест-системы для идентификации микроорганизмов – возбудителей внутрибольничных инфекций (ВБИ) с одновременным определением генетических детерминант, обуславливающих их лекарственную устойчивость к наиболее эффективным противомикробным препаратам, включая карбапенемы, цефалоспорины третьего поколения и препараты пенициллинового ряда.

Основные планируемые результаты проекта:
В ходе проекта должен быть разработан макет тест-системы для ускоренной идентификации возбудителей ВБИ с определением генетических детерминант, определяющих их лекарственную устойчивость к наиболее эффективным бактерицидным препаратам. Метод не подразумевает наличие стадии бактериологического культивирования организмов: в качестве исследуемых образцов должен анализироваться непосредственно клинический материал. Разработанная тест-система должна идентифицировать не менее 9-ти наиболее значимых возбудителей ВБИ и не менее 50 детерминант, определяющих устойчивость к наиболее эффективным антибиотикам.

Назначение и область применения, эффекты от внедрения результатов проекта:
Разработанная тест-система будет адаптирован для использования в лабораториях любого уровня, имеющего необходимые навыки в проведении стандартной ПЦР. Подразумевается, что наиболее эффективно метод должен использоваться в клинических лабораториях при лечебно-профилактических учреждениях, в которых проблема борьбы с ВБИ является особенно актуальной. По результатам оценки использование тест-системы может быть рекомендовано не только учреждениям МЗ РФ, но и специализированным учреждениям, входящих в состав ФСИН, МО, МЧС, ФМБА, а также в частные коммерческие лаборатории. Данные, полученные с использованием разработанной тест-системы, будут востребованы в работе клинических фармакологов и администрации лечебно-профилактических учреждений при планировании мер по сдерживанию распространения антибиотикорезистентности и выработки тактики рациональной антибактериальной терапии. Разработанные тест-системы могут стать удобным инструментом при проведении эпидемиологических исследований ВБИ как в конкретном ЛПУ, так и в масштабе РФ.

Текущие результаты проекта:
1. Определен спектр генетических мишеней, позволяющих идентифицировать отобранных возбудителей ВБИ и выявлять их устойчивость к антибиотикам.
2. Начат сбор коллекции чистых культур возбудителей ВБИ и диких (контрольных) штаммов микроорганизмов из биологического материала. Штаммы и их профиль антибиотикорезистентности определяются с помощью фенотипических, протеомных и молекулярных методов.
3. Начата разработка комплекта специальных реагентов - набора молекулярных зондов, обеспечивающих идентификацию возбудителей ВБИ и молекулярных детерминант устойчивости к антибактериальным препаратам (синтез и очистка зондов, иммобилизация на подложках, изготовление экспериментальных серий ДНК-чипов).