Регистрация / Вход
Прислать материал

Разработка молекулярного диагностического комплекса для определения прогноза и оптимальной тактики лечения больных раком молочной железы

Номер контракта: 14.604.21.0070

Руководитель: Дубина Михаил Владимирович

Должность: Первый проректор

Организация: федеральное государственное бюджетное учреждение высшего образования и науки "Санкт-Петербургский национальный исследовательский Академический университет Российской академии наук"
Организация докладчика: Федеральное государственное бюджетное учреждение высшего образования и науки «Санкт-Петербургский национальный исследовательский Академический университет Российской академии наук»

Аннотация скачать
Постер скачать
Ключевые слова:
молекулярная диагностика, рак молочной железы, экспрессионное профилирование, молекулярная медицина, онкология, биотехнология

Цель проекта:
Полногеномные методы экспрессионного анализа значительно уточнили существующую классификацию опухолей молочной железы. Однако до настоящего момента их применение ограничено сложностью методики, последующего анализа, а также отсутствие возможностей клинического применения. Дальнейшее изучение экспрессионных характеристик рака молочной железы и проведение клинических исследований со стратификацией больных на основании фенотипических особенностей может повысить эффективность существующих методов терапии. На настоящий момент требуется формирование ограниченной клинически применимой тест-системы, учитывающей все специфические подтипы опухолей этой локализации. Целью проекта является создание молекулярного диагностического комплекса (МДК) для высокоточного количественного определения активности важнейших патогенетических сигнальных каскадов злокачественных опухолей молочной железы, а также других генетических кластеров, определяющих индивидуальные особенности опухолей – для определения прогноза и оптимальной тактики лечения больных раком молочной железы.

Основные планируемые результаты проекта:
Набор маркеров (финальный набор генов) функциональная активность которых наиболее значимо и достоверно определяет характер клинического течения РМЖ, а также чувствительность заболевания к существующим методам лекарственной терапии. Лабораторный технологический регламент (ЛР) создания МДК для определения прогноза и оптимальной тактики лечения больных раком молочной железы и созданный на его основе экспериментальный образец МДК.

Краткая характеристика создаваемой/созданной научной (научно-технической, инновационной) продукции:
Проводимые в рамках настоящего проекта исследования являются логическим продолжением наиболее современных работ в этой области и позволят создать уникальный отечественный молекулярно-диагностический комплекс для определения прогноза и оптимальной тактики лечения больных РМЖ на уровне мировых аналогов.
Разрабатываемый МДК должен быть рассчитан на проведение 50 анализов и включать:
- реакционную смесь для выделения тотальной РНК из биологического материала;
- реакционную смесь для проведения обратной транскрипции;
- набор лиофилизированных прямых, обратных праймеров и соответствующих флуоресцентно меченых зондов, комплементарных нуклеотидным последовательностям финального набора генов (маркеров);
- флакон деионизованной, свободной от РНКаз и ДНКаз воды для растворения лиофилизированных прямых, обратных праймеров и соответствующих флуоресцентно меченых зондов;
- реакционную смесь для проведения полимеразной цепной реакции в режиме реального времени;
- инструкцию по применению и упаковку.
Экспериментальный образец МДК должен отвечать следующим основным требованиям:
- объем биологического образца для проведения одного анализа, мкг - не менее 30;
- диагностическая чувствительность, % - не менее 95;
- диагностическая специфичность, % - не менее 95;
- комплектация-полная;
- сроки хранения набора при - 20оС, мес. - не более 6.

Назначение и область применения, эффекты от внедрения результатов проекта:
Разрабатываемый МДК ориентирован на дальнейшее применение в практическом здравоохранении и секторе научных медико-биологических исследований, в том числе:
- в лечебных учреждениях, оказывающих специализированную и высокотехнологичную медицинскую помощь онкологическим больным;
- в научно-исследовательских учреждениях, занимающихся разработкой противоопухолевых препаратов.
Использование создаваемого МДК должно позволить в ближайшем будущем достичь значительного снижения потерь от данного социально значимого онкологического заболевания за счет улучшения клинических показателей, в первую очередь, за счет отбора потенциально чувствительных пациентов для каждого конкретного вида терапии.

Текущие результаты проекта:
Была теоретически выбрана панель, состоящая из 500 генов, функциональная активность которых вероятнее всего определяет клиническое течение РМЖ и чувствительность к существующим методам лекарственной терапии. Из всех образцов коллекции биологического материала были получены качественные образцы рибонуклеиновой кислоты в количестве, необходимом для дальнейшего проведения экспрессионного профилирования. Для полученных образцов методом NanoString был проведен экспрессионный анализ с использованием набора для оценки экспрессии генов, ассоциированных с гормон-зависимым раком молочной железы nCounter Virtual Breast Cancer Gene Set (202 гена). Также, для полученных образцов был проведен экспрессионный анализ с использованием микрочипов Аффиметрикс GeneChip® Human Gene 1.0 ST на системе GeneChip® Scanner 3000 7G. Была осуществлена обработка данных экспрессионного анализа и выбрана группа из 500 генов, связанных с течением заболевания и чувствительностью к существующим классам лекарственных препаратов. В результате сравнения с теоретически выбранной панелью генов были выявлены маркеры (финальный набора из 50 генов), функциональная активность которых наиболее значимо и достоверно определяет характер клинического течения РМЖ, а также чувствительность заболевания к существующим методам лекарственной терапии. Были разработаны варианты технических решений для создания МДК.