Регистрация / Вход
Прислать материал

Разработка набора реагентов для определения риска развития частых осложнений при хронической обструктивной болезни легких (ХОБЛ).

Номер контракта: 14.604.21.0075

Руководитель: Сазонов Алексей Эдуардович

Должность: главный научный сотрудник

Организация: федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования "Сибирский государственный медицинский университет" Министерства здравоохранения Российской Федерации
Организация докладчика: государственное бюджетное образовательное учреждение высшего профессионального образования "Сибирский государственный медицинский университет" Министерства здравоохранения Российской Федерации

Аннотация скачать
Постер скачать
Ключевые слова:
хроническая обструктивная болезнь легких, микробиом, секвенирование.

Цель проекта:
Реализуемый проект направлен на разработку способа оценки рисков жизнеугрожающих осложнений, в особенности роста частоты обострений, при хронической обструктивной болезни легких (ХОБЛ). Целью проекта является разработка экспериментального образца набора реагентов для оценки рисков частых осложнений при ХОБЛ на основе генетической информации о пациенте и состава микробиоты его легких и кала

Основные планируемые результаты проекта:
За период реализации проекта проведен аналитический обзор научных информационных источников по изучаемой проблеме, с использованием данных современной научной литературы. Сформирована клиническая анкета-опросник для пациентов с ХОБЛ. Для стандартизации полученного биологического материала (кала, орофарингеальных мазков и мокроты) разработаны методики подготовки и хранения биологического материала обследуемых индивидов. Сформирована электронная база однонуклеотидных полиморфизмов генома человека, связанных с предрасположенностью к заболеваниям легких. Сформирована коллекция биологического материала обследуемых индивидов.
В результате реализации проекта планируется проведение генотипирования индивидов и секвенирования образцов биологического материала с последующим биоинформатическим и статистическим анализом для поиска биомаркеров осложнений ХОБЛ.
На основе полученной информации будет разработан ПЦР-набор для определения биомаркеров осложнений ХОБЛ и сопутствующий ему алгоритм системной оценки рисков, реализованный в виде программного обеспечения.

Краткая характеристика создаваемой/созданной научной (научно-технической, инновационной) продукции:
В результате выполнения проекта будет создан ПЦР-набор для быстрого определения наличия микробиотных и генетических маркеров частых осложнений ХОБЛ с алгоритмом системной оценки рисков. В состав разрабатываемого набора будут входить специфические праймеры для регистрации маркерных микроорганизмов микробиоты легких и кишечника, а также однонуклеотидных полиморфизмов человека связанных с предрасположенностью к ХОБЛ. Алгоритм системной оценки рисков будет учитывать результат исследования биомаркеров при помощи ПЦР-набора и клиническую информацию о состоянии пациента, полученную при помощи анкета-опросника. Алгоритм будет реализован в виде сопутствующего программного обеспечения, выдающего по 100-бальной шкале риски осложнений. Для достижения заявленных результатов планируется проведение генотипирования индивидов и секвенирования образцов биологического материала для поиска маркерных микроорганизмов и полиморфизмов генома человека.

Назначение и область применения, эффекты от внедрения результатов проекта:
Разрабатываемый набор реагентов предназначен для определения наличия биомаркеров повышенного риска осложнений легочных заболеваний, в частности ХОБЛ. Область применения: научно-клинические учреждения здравоохранения, специализированные лечебно-профилактические учреждения, учреждения высшего профессионального образования и науки. Оценка комплексного статуса пациента, включающего в себя поиск полиморфизмов, ассоциированных с развитием ХОБЛ и его осложнений, оценка иммунного статуса по бактериальным маркерам кишечной микробиоты и поиск микробиотных маркеров в слизистой дыхательных путей даст дополнительную, клинически-значимую информацию для лечащего врача. Разработка и внедрение современных диагностических тест-систем для оценки генетических и микробиотических маркеров при ХОБЛ позволит создать новые подходы к персонифицированной терапии данного заболевания, что будет способствовать улучшению качества жизни пациентов, снизит затраты на их лечение, прямые (медикаментозное обеспечение, дорогостоящая экстренная медицинская помощь) и косвенные (длительные периоды нетрудоспособности, выплаты по инвалидности) затраты ресурсов здравоохранения.

Текущие результаты проекта:
За период второго года реализации проекта разработана методика оценки качества образцов биологического материала, содержащего метагеномные сообщества – образцов орофарингеального мазка, мокроты и кала. Создана коллекция образцов микробиоты. Коллекцию составили 150 образцов кала, 500 образцов орофарингеального мазка и 150 образцов мокроты. Разработаны методики выделения бактериальной ДНК из образцов биологического материала: кала, мокроты и орофарингеальных мазков. Сформирована коллекции образцов буккального соскоба для генетического профилирования, составляющая 150 образцов. Сформированы технические требования и предложения по разработке, производству и эксплуатации продукции. Выделена ДНК и проведено секвенирование по маркерным генам бактериальной 16S рРНК для 300 образцов орофарингеального мазка и 60 образцов мокроты.