Регистрация / Вход
Прислать материал

Выявление биомаркеров микробиотического сообщества кишечника для ранней, доклинической диагностики болезни Паркинсона

Номер контракта: 14.604.21.0150

Руководитель: Алифирова Валентина Михайловна

Должность: Заведующая кафедрой

Организация: федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования "Сибирский государственный медицинский университет" Министерства здравоохранения Российской Федерации
Организация докладчика: государственное бюджетное образовательное учреждение высшего профессионального образования "Сибирский государственный медицинский университет" Министерства здравоохранения Российской Федерации

Аннотация скачать
Постер скачать
Ключевые слова:
микробиом, микробиота, болезнь паркинсона, биомаркер, секвенирование

Цель проекта:
Цели: исследовать состав микробиотического сообщества кишечника с целью выявления биомаркеров для разработки доклинической диагностики болезни Паркинсона; создать алгоритм доклинической диагностики болезни Паркинсона с использованием перечня биомаркеров микробиотического сообщества кишечника. Задачи: набор биологического материала; выделение ДНК из биологического материала; получение полногеномных метагеномных профилей микробиоты кишечника методом NGS-секвенирования; биоинформационный анализ полногеномных метагеномных профилей микробиоты кишечника; поиск ассоциации между составом микробиоты кишечника и наличием БП; разработка способа доклинической диагностики болезни Паркинсона с использованием биомаркеров микробиотического сообщества кишечника; разработка алгоритма доклинической диагностики болезни Паркинсона с использованием биомаркеров микробиотического сообщества кишечника.

Основные планируемые результаты проекта:
Будет создана коллекция образцов микробиоты (кала): не менее 100 образцов от пациентов с БП, а также 100 образцов от пациентов группы контроля. Для стандартизации полученного биологического материала будет разработана методика оценки качества образцов биологического материала, содержащего метагеномные сообщества (кала), соответствующая стандартам качества материалов международных консорциумов по исследованию микробиоты человека. Для оценки качества коллекции микробиоты будет проведено исследование всех образцов из коллекции и проведена выбраковка не прошедших контроль качества. Сформирована коллекция образцов кала для генетического профилирования, составляющая 200 образцов. Будет создана база данных содержащая информацию о генах-маркерах патологической микробиоты. Будут разработаны и исследованы варианты возможных решений задачи и выбран оптимальный вариант решения. Будет разработан способ и алгоритм доклинической диагностики болезни Паркинсона с использованием биомаркеров микробиотического сообщества кишечника. По результатам выполнения ПНИ будут опубликованы 6 статей в научных журналах, индексируемых в базе данных Scopus, РИНЦ или в базе данных "Сеть науки" (WEB of Science), 2 заявки на патент. Будет разработано техническое задание на проведение опытно-конструкторских работ.

Краткая характеристика создаваемой/созданной научной (научно-технической, инновационной) продукции:
Оценка состава сообщества микроорганизмов кишечного эпителия с целью выявления молекулярных маркеров для доклинической диагностики болезни Паркинсона. Разработка алгоритма оценки рисков развития болезни Паркинсона по составу микробиоты слизистой оболочки кишечника даст дополнительную, клинически значимую информацию для враче. Данный подход позволит оптимизировать тактику ведения пациентов с болезни Паркинсона на премоторной стадии, сократив время диагностических процедур и затраты на фармакотерапию.

Назначение и область применения, эффекты от внедрения результатов проекта:
Исследуемые биомаркеры будут предназначены для доклинической диагностики болезни Паркинсона. На их основе, в дальнейшем, возможно создание диагностических тест-систем для определения вероятности развития болезни Паркинсона до первых клинических проявлений. Применение полученных результатов возможно в научно-клинических учреждениях здравоохранения, специализированных лечебно-профилактических учреждениях, учреждениях высшего профессионального образования и науки.

Текущие результаты проекта:
Создана коллекция образцов микробиоты (кала). Коллекцию составили 100 образцов от пациентов с БП, а также 100 образцов от пациентов группы контроля. Для стандартизации полученного биологического материала разработана методика оценки качества образцов биологического материала, содержащего метагеномные сообщества (кала). Проведен подбор и анализ научной литературы и методических рекомендаций касательно методов оценки качества образцов микробиоты, отобраны и сравнены наиболее подходящие методики, на основе которых разработана методика контроля качества. Для оценки качества коллекции микробиоты проведено исследование всех образцов из коллекции и проведена выбраковка не прошедших контроль качества. Сформирована коллекция образцов кала для генетического профилирования, составляющая 200 образцов.