Регистрация / Вход
Прислать материал

14.604.21.0070

Аннотация скачать
Постер скачать
Общие сведения
Номер
14.604.21.0070
Тематическое направление
Науки о жизни
Исполнитель проекта
федеральное государственное бюджетное учреждение высшего образования и науки "Санкт-Петербургский национальный исследовательский Академический университет Российской академии наук"
Название доклада
Разработка молекулярного диагностического комплекса для определения прогноза и оптимальной тактики лечения больных раком молочной железы
Докладчик
Богданов Алексей Александрович; Моисеенко Федор Владимирович
Тезисы доклада
Цели и задачи исследования
Полногеномные методы экспрессионного анализа значительно уточнили существующую классификацию опухолей молочной железы. Однако до настоящего момента их применение ограничено сложностью методики, последующего анализа, а также отсутствие возможностей клинического применения. Дальнейшее изучение экспрессионных характеристик рака молочной железы и проведение клинических исследований со стратификацией больных на основании фенотипических особенностей может повысить эффективность существующих методов терапии. На настоящий момент требуется формирование ограниченной клинически применимой тест- системы, учитывающей все специфические подтипы опухолей этой локализации.
Целью проекта является создание молекулярного диагностического комплекса (МДК) для высокоточного количественного определения активности важнейших патогенетических сигнальных каскадов злокачественных опухолей молочной железы, а также других генетических кластеров, определяющих индивидуальные особенности опухолей – для определения прогноза и оптимальной тактики лечения больных раком молочной железы.
Актуальность и новизна исследования
Вопрос экспрессионного профиля опухолей молочной железы активно изучается во всем мире с 2000 года. К настоящему моменту основополагающей является молекулярно-генетическая классификация рака молочной железы, разработанная на основании определения экспрессии 8 102 генов в 65 образцах опухоли молочной железы. Со времени публикации этих результатов было проведено не менее 10 аналогичных работ, уточняющих первичные данные. На основании проведенных исследований были разработаны и клинически апробированы предиктивный экспрессионный набор – Oncotype DX (Genomic Health) и прогностические экспрессионные наборы - 76 генный Роттердамский профиль и Геномный индекс степени злокачественности (Genomic Grade Index). Проводимые в рамках настоящего проекта исследования является логическим продолжением наиболее современных работ в этой области и позволят создать уникальный отечественный молекулярно-диагностический комплекс (МДК) для определения прогноза и оптимальной тактики лечения больных РМЖ, не имеющий аналогов в мире.
Описание исследования

Был выполнен аналитический обзор современной научно-технической, нормативной, методической литературы, затрагивающей научно-техническую проблему, исследуемую в рамках проекта, в том числе обзор научных информационных источников: статьи в ведущих зарубежных и (или) российских научных журналах, монографии и (или) патенты) - не менее 15 научно-информационных источников за период 2009 – 2013 гг. Были выполнены патентные исследования в соответствии с ГОСТ 15.011-96. Былиисследованы, обоснованы и выбраны методы и средства, направления исследований и способы решения поставленных задач. На основе крупных проспективных исследований была теоретически выбрана панель генов, состоящая из 500 генов, функциональная активность которых определяет клиническое течение РМЖ и чувствительность к существующим методам лекарственной терапии. Для проведения экспрессионного профилирования быть создана коллекция биологического материала в виде образцов ткани молочной железы, полученных  от 101 пациента с РМЖ и 50 здоровых доноров. Было проведено экспрессионное профилирование полученного биологического материала с использованием микрочипа Аффиметрикс GeneChip® Human Gene 1.0 ST (или аналога) и с использованием методики NanoString, NanoString® Technologies, Inc. На основании анализа данных экспрессионного профилирования была выбрана панель генов, состоящая из 500 генов, связанных с течением заболевания и чувствительностью к существующим классам лекарственных препаратов. Полученная в результате обработки данных экспрессионного профилирования панель генов была сопоставлена с панелью генов, теоретически выявленной на основе крупных проспективных исследований, и был определен набор маркеров (финальный набор генов), состоящий  из 50 генов, функциональная активность которых наиболее значимо и достоверно определяет характер клинического течения РМЖ, а также чувствительность заболевания к существующим методам лекарственной терапии. Были разработаны варианты технических решений по созданию МДК на основе определенного набора маркеров (финального набора генов). Быт разработан проект Лабораторного регламента (ЛР) создания МДК для определения прогноза и оптимальной тактики лечения больных раком молочной железы. Был изготовлен экспериментальный образец МДК для определения прогноза и оптимальной тактики лечения больных раком молочной железы. Была разработана Программа и методики исследовательских испытаний экспериментального образца МДК.Для проведения испытаний экспериментального образца МДК  была создана контрольная коллекция биологического материала в виде образцов ткани молочной железы от 25 пациентов с РМЖ и 25 здоровых доноров, случайным образом отобранных из коллекции биологического материала, предназначенной для проведения экспрессионного профилирования. Были проведены испытания экспериментального образца МДК с использованием контрольной коллекции биологического материала в соответствии с Программой и методиками исследовательских испытаний. По результатам испытаний  была проведена доработка технического решения экспериментального образца МДК.

 

Результаты исследования

В ходе выполнения  предварительных теоретических исследований был произведен подбор баз данных крупных проспективных исследований и 1214 гена, функциональная активность которых может определять клиническое течение РМЖ и чувствительность к существующим методам лекарственной терапии. На основании полученных данных была теоретически выбрана панель, состоящая из 500 генов, функциональная активность которых вероятнее всего определяет клиническое течение РМЖ и чувствительность к существующим методам лекарственной терапии. Были созданы коллекция и контрольная коллекция биологического материала, содержащая образцы ткани молочной железы от пациентов с РМЖ и здоровых доноров. Из всех образцов коллекции биологического материала были получены качественные  образцы  рибонуклеиновой  кислоты  в количестве, необходимом для дальнейшего проведения экспрессионного профилирования. Для полученных образцов методом NanoString и с использованием технологии Аффиметрикс был проведен экспрессионный анализ. Была осуществлена обработка данных экспрессионного анализа и выбрана группа из 500 генов, связанных с течением заболевания и чувствительностью к существующим классам лекарственных препаратов. В результате сравнения с теоретически выбранной панелью генов были выявлены маркеры (финальный набора из 50 генов), функциональная активность которых наиболее значимо и достоверно определяет характер клинического течения РМЖ, а также чувствительность заболевания к существующим методам лекарственной терапии. Были разработаны варианты технических решения для создания МДК. На основании полученных технических решений был изготовлен экспериментальный образец МДК для определения прогноза и оптимальной тактики лечения больных раком молочной железы. Была разработана Программа и методики исследовательских испытаний экспериментального образца МДК. На контрольной коллекции  биологического материала успешно осуществлены испытания экспериментального образца МДК в соответствии с  Программой и методиками  исследовательских  испытаний. были получены требуемые значения основных параметров МДК: значение диагностической чувствительности (Se) в условиях исследовательских испытаний составило: Se = 96 %; значение диагностической специфичности (Sp) в условиях испытаний составило Sp=100 %. На основании данных испытаний были доработаны компоненты  экспериментального образца МДК и проведены их испытания.

 

Практическая значимость исследования
Разрабатываемый МДК ориентирован на дальнейшее применение в практическом здравоохранении и секторе научных
медико-биологических исследований, в том числе:
• в лечебных учреждениях, оказывающих специализированную и высокотехнологичную медицинскую помощь
онкологическим больным;
• в научно-исследовательских учреждениях, занимающихся разработкой противоопухолевых препаратов.
Использование создаваемого МДК позволит в ближайшем будущем достичь значительного снижения потерь от социально-
значимых онкологических заболеваний за счет улучшения клинических показателей, в первую очередь, за счет отбора
потенциально чувствительных пациентов для каждого конкретного вида терапии.