Регистрация / Вход
Прислать материал

Поиск потенциальных генетических маркеров неспецифического язвенного колита на примере полиморфизма цитокинов семейства IL-1

Сведения об участнике
ФИО
Петрова Евгения Олеговна
Вуз
Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего профессионального образования "Челябинский государственный университет"
Тезисы (информация о проекте)
Область наук
Науки о жизни и медицина
Раздел области наук
Общая биология и генетика
Тема
Поиск потенциальных генетических маркеров неспецифического язвенного колита на примере полиморфизма цитокинов семейства IL-1
Резюме
Многочисленные научные исследования подтверждают взаимосвязь повышенной экспрессии некоторых представителей цитокинового семейства IL-1 с развитием воспалительных процессов. В работе отражено исследование взаимосвязи полиморфизма IL-1β в точке +3953 с заменой цитозина на тимин (C/T) с развитием неспецифического язвенного колита (НЯК). Установлено, что настоящий полиморфизм влияет на усиление экспрессии провоспалительного цитокина IL-1β. Однако, в исследуемой нами популяции русских Челябинской области, различия по частоте встречаемости аллелей и генотипов SNP +3953 C/T среди опытной и контрольной групп не были статистически значимыми: СС (р = 0,34), CT (p = 0,67), TT (p = 0,24).
Ключевые слова
полиморфизм, IL-1β, ИЛ-1бета, неспецифический язвенный колит, НЯК, цитокины, биомаркер, SNP +3953 C/T, воспалительные заболевания кишечника, ВЗК.
Цели и задачи
Целью научной работы является изучение распределения частот встречаемости аллелей и генотипов SNP +3953 C/T IL-1β у больных НЯК и условно-здоровых лиц.
Для достижения настоящей цели были поставлены следующие задачи:
• Оценить частоты встречаемости аллелей и генотипов SNP +3953 C/T IL-1β у пациентов с НЯК;
• Выявить наличие или отсутствие ассоциации SNP +3953 C/T IL-1β с предрасположенностью/устойчивостью к НЯК в русской популяции ЧО;
• Изучить распределение частот встречаемости аллелей и генотипов SNP +3953 C/T IL-1β у больных НЯК в зависимости от пола.
Введение

Этиология неспецифического язвенного колита (НЯК) на сегодняшний день остается не выясненной, при этом данное воспалительное заболевание характеризуется тяжелым эрозивно-геморрагическим течением с последующим развитием осложнений, опасных для жизни и здоровья человека. Известно, что сбои в работе иммунной системы могут провоцировать генерализованные воспалительные процессы, поэтому мы остановились на исследовании полиморфизма провоспалительного цитокина семейства IL-1 как потенциального биомаркера НЯК. Изучаемый нами полиморфизм +3953 C/T локализован на уровне 5 экзона и влияет на усиление экспрессии IL-1β, что может способствовать развитию воспалительного процесса.

Методы и материалы

В качестве основного метода исследования послужила аллель-специфическая полимеразная цепная реакция (ПЦР), для постановки которой мы использовали реактивы научно-производственной фирмы "Литех". Выделение ДНК проводили колоночным методом по немецкой системе Protrans DNA Box 500. Визуализацию результатов проводили в 3%-ном агарозном геле при проходящем УФ-свете. Для статистической обработки данных использовали программу Past, в которой руководствовались тремя статистическими критериями: критерий χ2 Пирсона, критерий χ2 Пирсона с поправкой по Йетсу, точный двусторонний критерий Фишера. Данные считались статистически значимыми при р ≤ 0,05.

Материалом исследования послужила периферическая венозная кровь потенциальных доноров костного мозга, предоставленная ГБУЗ "Челябинская областная станция переливания крови" (контрольная группа), и периферическая венозная кровь пациентов с неспецифическим язвенным колитом (НЯК), предоставленная ГБУЗ "Челябинская областная клиническая больница" и НУЗ "Дорожная клиническая больница" (опытная группа). В ходе научно-исследовательской работы были исследованы 234 образца периферической венозной крови условно-здоровых лиц (контрольная группа) и 139 образцов крови пациентов с НЯК (опытная группа).

Описание и обсуждение результатов

Результаты нашего исследования показали отсутствие ассоциации изучаемого полиморфизма с предрасположенностью/ устойчивостью к НЯК по частоте встречаемости как аллелей (р = 0,22), так и генотипов: СС (р = 0,34), CT (p = 0,67), TT (p = 0,24). Также не было выявлено статистически значимых различий по встречаемости  SNP +3953 C/T IL-1β в зависимости от пола.

В виду полученных результатов, можно сделать вывод о том, что в различных популяциях полиморфизмы цитокинов проявляют себя неоднозначно, в некоторых они оказывают определенное влияние на развитие болезни, а в некоторых — нет. Наше исследование показало, что изучаемый нами полиморфизм не играет важной роли в развитии НЯК в популяции русских Челябинской области. Поэтому мы собираемся расширить свое исследование, включив в него еще несколько представителей  семейства IL-1, ассоциация с которыми была выявлена в европеоидных популяциях, генотипы которых являются наиболее приближенными к генотипу русских Челябинской области (о чем свидетельствует отсутствие статистически значимых различий по встречаемости аллелей различных полиморфизмов в европеоидных популяциях и популяции русских ЧО). Также мы планируем изучить, как смещение баланса IL-1β и IL-1Ra в ту или иную сторону отражается на развитии воспалительного процесса.

Используемые источники
1. Yamamoto-Furusho JK, Santiago-Hernandez JJ, Perez-Hernandez N, Ramirez-Fuentes S, Fragoso JM, Vargas-Alarcon G. Interleukin 1 β (IL-1B) and IL-1 antagonist receptor (IL-1RN) gene polymorphisms are associated with the genetic susceptibility and steroid dependence in patients with ulcerative colitis. J Clin Gastroenterol. 2011 Jul;45(6):531-5.
2. Ito H, Kaneko K, et al. Interleukin-1beta gene in esophageal, gastric and colorectal carcinomas. Oncol Rep. 2007 Aug;18(2):473-81.
3. Nohara H, Saito Y, et al. Polymorphisms of the IL-1beta and IL-1beta-inducible genes in ulcerative colitis. J Gastroenterol. 2002 Nov;37 Suppl 14:107-10.
4. Farshad S, Rasouli M, et al. IL-1ß (+3953 C/T) and IL-8 (-251 A/T) gene polymorphisms in H. pylori mediated gastric disorders. Iran J Immunol. 2010 Jun;7(2):96-108.
Information about the project
Surname Name
Petrova Evgeniya
Project title
Search potential genetic markers for ulcerative colitis on the example polymorphism of the cytokine IL-1 family
Summary of the project
Numerous scientific studies confirm the relationship of increased expression of some members of the cytokine IL-1 family with the development of inflammatory processes. The paper reflects the study of the relationship of polymorphism of IL-1β at the point +3953 with the replacement of cytosine to thymine (C / T) with the development of ulcerative colitis (UC). It was found that this polymorphism affects the increase in the expression of the proinflammatory cytokine IL-1β. However, in the studied population of Russian Chelyabinsk region, differences in the frequency of occurrence of alleles and genotypes of SNP +3953 C / T among the experimental and control groups were not statistically significant: CC (p = 0,34), CT (p = 0,67) , TT (p = 0,24).
Keywords
Polymorphism, IL-1β, IL-1beta, ulcerative colitis, UC, cytokines, biomarker, SNP +3953 C/T, inflammatory bowel disease, IBD.