Регистрация / Вход
Прислать материал

Создание пакета прикладных программ для оценки токсичности химических соединений.

Стадии проекта
Предложение принято
Конкурс завершен
Выполнение этапа проекта
Проект
02.434.11.1014
Организация
ИФАВ РАН
Продолжительность работ
2005 - 2006, 11 мес.
Бюджетные средства
5,5 млн
Внебюджетные средства
0 млн

Создание программного продукта для оценки токсичности химических веществ на основе комбинированного анализа данных о структуре вещества и о его взаимодействии с организмом

Соисполнители

Организация
ИБМХ

Этапы проекта

1
17.11.2005 - 08.12.2005
Разработан общий алгоритм программного комплекса. Разработан алгоритм поиска и анализа научных текстов (Text Mining). Определена структура входных и выходных данных. Выбраны технические средства для функционирования программного комплекса. Достигнуты следующие технико-экономические показатели: Проблемно-ориентированных поисковых исследований фундаментального характера, по приоритетным направлениям научно-технологического развития (И1.2.1) выполнено1. В рецензируемых научных журналах опубликовано 2 работы, содержащих информацию о результатах интеллектуальной деятельности, полученных в рамках выполнения проекта (И1.2.2). Защищена 1 диссертация на соискание ученой степени кандидата наук. Разрабатываемый ПК ориентирован на применение в биомедицине и экотоксикологии. Представлен промежуточный научно-технический отчет по 1 этапу работы по контракту.
Развернуть
2
01.01.2006 - 30.06.2006
1 Проведены патентные исследования в соответствии ГОСТ Р 15.011 -96
«СРПТТП. Патентные исследования».
2 Разработаны вспомогательные вычислительные методы оценки физико-
химических свойств и биологической активности химических
соединений.
3 Разработана математическая модель для оценки токсичности
химических соединений на основе комбинированного анализа
собранных данных.
4 Разработаны алгоритмы и программы оценки сходства молекулярных
структур, физико-химических свойств, биологической активности и
токсичности химических соединений;
5 Начато формирование баз данных путем сбора опубликованной
экспериментальной информации о токсичности химических соединений.
6 Разработан комплект программной документации для программы
КРАТОКС в соответствии с п. 4.6 технического задания.
7 Начата разработка программных компонентов программного комплекса
на основе разработанных методик и алгоритмов, в том числе
вспомогательных вычислительных методов для оценки физико-
химических свойств и биологической активности химических
соединений.
8 Разработаны рекомендации по оптимизации (минимизации) объема
экспериментальных исследований, необходимых для получения
достоверной оценки токсичности по косвенным данным.
9 Составлен промежуточный отчет.
Достигнуты следующие технико-экономические показатели: Начато 2 проблемно-ориентированных поисковых исследований фундаментального характера, по приоритетным направлениям научно-технологического развития (И1.2.1).
В рецензируемых научных журналах опубликована 1 работа, содержащая информацию о результатах интеллектуальной деятельности, полученных в рамках выполнения проекта. Опубликованы тезисы 2 докладов на международной конференции (И1.2.2).
Получено свидетельство Роспатента РФ о государственной регистрации программы для ЭВМ «КРАТОКС» (Классификатор Распределения ТОКСикантов), № 2006611334 от 20.04.2006 г. (И1.2.3). Защищена 1 диссертация на соискание ученой степени кандидата наук (И1.2.4).
Разрабатываемый ПК ориентирован на применение в биомедицине и
экотоксикологии.
Развернуть
3
01.07.2006 - 30.09.2006
В ходе работ по выполнению госконтракта № 02.434.11.1014 от 17 ноября 2005 г. все предусмотренные Техническим заданием и Календарным планом задачи третьего этапа успешно выполнены.
Были проведены дополнительные патентные исследования в соответствии ГОСТ Р 15.011-96 «СРППП. Патентные исследования». В рамках проекта разработаны наборы стандартных тестовых систем, обеспечивающих тестирование разрабатываемого ПК, по оценке достоверности алгоритмических схем и их быстродействия. Разработаны методики тестирования программного комплекса по оценке достоверности алгоритмических схем и их быстродействия. Тестовые исследования были проведены в соответствии с техническим заданием. Также были окончательно сформированы базы данных, отработаны тестовые системы и методики тестирования. На заключительной стадии был отлажен программный комплекс в целом. Были разработаны средства для обучения пользователей: методические пособия и тестовые обучающие примеры.
Исследования показали высокую точность прогноза классов LD50, специфической токсичности и механизмов действия. Средняя точность прогноза, рассчитанная по методу скользящего контроля с исключением по одному, для обучающих выборок составляла 81,8%, 83,8% и 87% соответственно.
В рамках проекта в рецензируемые научные журналы была направлены 4 статьи, содержащих информацию о результатах интеллектуальной деятельности, полученных в рамках выполнения проекта. За время выполнения работ по 3 этапу была опубликована 1 статья в российском научном журнале.
Развернуть
4
01.10.2006 - 31.10.2006
АННОТАЦИЯ РАБОТ, ВЫПОЛНЕННЫХ НА 4 ЭТАПЕ ПРОЕКТА

Создание пакета прикладных программ для оценки токсичности
химических соединений
Шифр 2005-ИТ-12.5/004/001

Государственный контракт от «17» ноября 2005 г. № 02.434.11.1014
в рамках ФЦНТП «Исследования и разработки по приоритетным направлениям
развития науки и техники» на 2002–2006 годы»


В представленном отчете описаны алгоритмы и методы, использованные в разработанном программном комплексе КРАТОКС/ПРЕТОКС, а также исследования, результаты которых были использованы при его разработке. Описан состав и принципы работы программного комплекса, охарактеризованы входные и выходные данные. Приведено описание набора стандартных тестовых систем и методики тестирования программного комплекса по оценке достоверности алгоритмических схем и их быстродействия. Представлены результаты проведения тестовых исследований программного комплекса по предсказанию общей и специфической токсичности, молекулярных мишеней, ассоциированных с токсичностью. Исследования показали высокую точность прогноза классов LD50, специфической токсичности, механизмов действия и физико-химических свойств. Показано, что в значительной части случаев возможно предсказание величины LD50 с достаточной точностью. В отчете приведены описания методических пособий и тестовых обучающих примеров. Описаны мероприятия, выполненные в рамках заключительного этапа работы. Программный комплекс КРАТОКС/ПРЕТОКС предназначен для использования в фундаментальных исследованиях и прикладных разработках с целью выявления новых безопасных и эффективных биологически активных веществ; не основывается на программных продуктах, требующих лицензионных отчислений от пользователей; превосходит в функциональности по параметрам токсичности свои известные аналоги.

Научный руководитель,
доктор химических наук,
профессор _______________О.А.Раевский
подпись, дата

Директор ИФАВ РАН,
член-корреспондент РАН, ______________ С.О.Бачурин
  «____» _____________ 2006 г
Развернуть

Программа

Программа "Исследования и разработки по приоритетным направлениям развития науки и техники" на 2002-2006 годы

Программное мероприятие

1.2 Проблемно-ориентированные поисковые исследования фундаментального характера
Продолжительность работ
2005 - 2006, 16 мес.
Бюджетные средства
10 млн
Организация
ИХФ РАН
профинансировано
Продолжительность работ
2014 - 2016, 26 мес.
Бюджетные средства
15,96 млн
профинансировано
Тема
Создание пакета прикладных программ для оценки токсичности химических соединений
Продолжительность работ
2005 - 2006, 23 мес.
Бюджетные средства
5,5 млн
Количество заявок
2
Тема
Быстродействующая переносная портативная мультисенсорная система обнаружения и идентификации токсичных химических веществ.
Продолжительность работ
2005 - 2006, 23 мес.
Бюджетные средства
10 млн
Количество заявок
6
Тема
Развитие перспективных методик анализа биомедицинских образцов для исследований токсичности и фармакокинетики химических соединений
Продолжительность работ
2013, 5 мес.
Бюджетные средства
30 млн
Количество заявок
3
Тема
Электрохимические системы для специфической детекции микробных клеток и токсичных соединений
Продолжительность работ
2005 - 2006, 23 мес.
Бюджетные средства
5 млн
Количество заявок
3
Тема
Разработка технологий синтеза химических веществ, компьютерного моделирования их воздействия на биохимические процессы внутри организма и создание библиотек натуральных и синтетических биоактивных соединений, используемых при создании лекарственных средств, в том числе противовирусных препаратов.
Продолжительность работ
2005 - 2006, 23 мес.
Бюджетные средства
18,6 млн
Количество заявок
0