Регистрация / Вход
Прислать материал

Исследование генетической гетерогенности сельскохозяйственных животных на основе анализа полиморфизма ДНК-маркеров.

Стадии проекта
Предложение принято
Конкурс завершен
Выполнение этапа проекта
Проект
02.434.11.7024
Организация
ФГБНУУ ВНИИГРЖ

Проведение поисковых исследований и получение новых знаний с использованием возможностей международной кооперации

Этапы проекта

1
07.11.2005 - 08.12.2005
Анализ научной литературы позволил обосновать выбор направления исследований и разработать общую методику проведения исследований, а также поставить методы выделения и исследования ДНК, идентификации генов и уровня полиморфизма микросателлитных ДНК у крупного рогатого скота. Определена частота полиморфных вариантов и уровень гетерозиготности в ряде опытных групп крупного рогатого скота. Проведено генотипирование быков производителей на предмет носительства определенных типов каппа-казеина и скрытых генетических дефектов BLAD и DUMPS. Анализ встречаемости аллелей по каппа-казеиновому локусу показал нарушение генетического равновесия в сторону повышенной частоты аллели А над аллелью В. Задачи, поставленные в техническом задании, полностью выполнены на высоком методическом уровне с использованием современных методов исследования ДНК и генов – ДНК-фингерпринтинга и ПЦР. Результаты исследований позволяют по завершении работ представить рекомендации для организаций по племенной работе о необходимости генотипирования племенного ядра (быков производителей и матерей быков) на носительство скрытых генетических дефектов и определения частоты типов гена каппа-казеина для улучшения структуры племенного стада. Результаты определения генетических параметров коэффициентов генетического сходства, генетических расстояний и гетерозиготности могут использоваться для контроля генетической структуры популяций крупного рогатого скота и для разработки технологии гетерогенного и гомогенного подбора. Распространение генетического дефекта BLAD среди быков производителей значительно снижают у потомства устойчивость к заболеваниям.
Развернуть
2
01.01.2006 - 31.05.2006
Проведено определение генетических расстояний, коэффициентов генетических различий и сходства, гетерозиготности отдельных популяций и пород сельскохозяйственных животных. Разработано обоснование использования результатов исследований в селекции в организациях по племенной работе с крупным рогатым скотом. Составлен промежуточный акт.
Развернуть
3
01.06.2006 - 31.10.2006
Результаты и краткое описание НИР. На основе анализа научной литературы обоснован выбор направления исследований и разработана общая методика и программа проведения исследований, освоены методы выделения и исследования ДНК на уровне регистрации полиморфизма микросателлитных ДНК у крупного рогатого скота. Произведен выбор наиболее надежных статистических методов расчета генетических параметров (частоты аллелей, коэффициента генетического сходства, генетических расстояний и гетерозиготности). Определена частота полиморфных вариантов и уровень гетерозиготности в ряде опытных групп различных пород крупного рогатого скота. Анализ трех пород коров ярославской, черно-пестрой и холмогорской позволил выявить маркерные фрагменты для каждой из изучаемых пород. Имеются различия между породами по числу полос на дорожку, что свидетельствует о различной степени полиморфизма изучаемых микросателлитных ДНК. Проведенная оценка гетерозиготности выявила меньшее генетическое разнообразие в популяции скота ярославской породы. Возможно, на консолидацию породы оказывает влияние снижение числа используемых быков-производителей. Основываясь на полученных результатах, можно сделать вывод, что фенотипический отбор животных по продуктивности приводит к сужению генотипической изменчивости, и при анализе картин ДНК-фингерпринтов наблюдали увеличение числа общих для животных полос, характеризующих популяцию, и как следствие снижение гетерозиготности. Следует отметить, что показатели гетерозиготности для группы высокопродуктивных животных были несколько ниже, чем для группы коров с относительно низкой продуктивностью.
Основываясь на полученных результатах, можно снова сделать вывод, что фенотипический отбор животных по продуктивности, приводит к сужению генотипической изменчивости. Анализ картин ДНК-фингерпринтов показал, что у группы животных, подвергшейся интенсивной селекции снижается как число выявляемых ДНК-фрагментов, так и показатели гетерозиготности.
Результаты определения генетических параметров коэффициентов генетического сходства, генетических расстояний и гетерозиготности могут служить достаточным обоснованием к использованию этих показателей для контроля генетической структуры популяций крупного рогатого скота и для разработки технологии гетерогенного и гомогенного подбора. Научно-технический уровень выполненной НИР находится на уровне мировых достижений в области исследования генетической гетерогенности сельскохозяйственных животных. Фундаментальные данные, полученные на основе изучения полиморфизма минисателлитных ДНК, генетических расстояний и гетерозиготности пород и популяций крупного рогатого скота в России с сравнительный анализ подобных результатов на крупном рогатом скоте в Бразилии позволяет судить о степени дивергенции пород и служит объективным обоснованием к обмену генетическим материалом между двумя странами.
Развернуть

Программа

Программа "Исследования и разработки по приоритетным направлениям развития науки и техники" на 2002-2006 годы

Программное мероприятие

1.2 Проблемно-ориентированные поисковые исследования фундаментального характера
Продолжительность работ
2011 - 2013, 29 мес.
Бюджетные средства
1,2 млн
Организация
Томский НИМЦ
профинансировано
Тема
Разработка методов генетической паспортизации и создание молекулярных тест-систем у животных - объектов сельскохозяйственного и медико-ветеринарного назначения.
Продолжительность работ
2008, 3 мес.
Бюджетные средства
1,2 млн
Количество заявок
5
Тема
Создание инновационных наборов реагентов для обеспечения эффективного контроля за возбудителями болезней сельскохозяйственных растений, кандидатных вакцин на основе структурно модифицированных вирусов растений и генетических конструкций для повышения устойчивости к возбудителям болезней сельскохозяйственных животных или растений
Продолжительность работ
2013, 2 мес.
Бюджетные средства
16 млн
Количество заявок
8
Тема
Разработка технологии генодиагностики и создание диагностической тест-системы для определения индивидуального генетического риска развития острого инсульта на основании анализа полиморфных ДНК маркеров.
Продолжительность работ
2009 - 2011, 31 мес.
Бюджетные средства
120 млн
Количество заявок
3
Тема
Разработка технологий воспроизводства высокоценных племенных сельскохозяйственных животных
Продолжительность работ
2017 - 2018, 14 мес.
Бюджетные средства
58 млн
Количество заявок
4
Тема
Разработка методологических основ создания информационного и программного обеспечения для анализа функционального эффекта полиморфизма белков человека, полученного из индивидуальных геномов.
Продолжительность работ
2009 - 2010, 14 мес.
Бюджетные средства
8 млн
Количество заявок
1