Регистрация / Вход
Прислать материал

Выявление взаимодействующих белков на основе данных сравнительной геномики.

Стадии проекта
Предложение принято
Конкурс завершен
Выполнение этапа проекта
Проект
02.442.11.7233
Организация
ИБМХ
Продолжительность работ
2005, 1 мес.
Бюджетные средства
0,35 млн
Внебюджетные средства
0 млн

Информация отсутствует

Этапы проекта

1
27.10.2005 - 25.11.2005
• Осуществлен поиск литературы, в которой представлены математические модели взаимодействия белков, отобрано более 100 источников;
• Проведен предварительный анализ литературы, который показал перспективность использования теории графов для описания сетевого взаимодействия белков, а также наличие разработанных алгоритмов анализа сетей взаимодействующих белков;
• Осуществлен поиск некоммерческого программного обеспечения, реализующего математические методы и алгоритмы обработки геномов и протеомов;
• Разработана программная система для математического моделирования взаимодействия белков, включающая в себя базу данных, вычислительный блок, блок интерфейса с внешними интернет ресурсами, и блок сервера – интерпретатора текстовых команд;
• Установлена и настроена локальная версия программы BLAST. Успешно осуществляется взаимодействие с ней при помощи языка Perl и пакета расширений BioPerl.
• База данных реализована с помощью СУБД MySQL. В качестве одного из модулей вычислительного блока реализован метод генетических профилей на основе ПО BLAST. Разработан функциональный интерфейс между интерпретатором Matlab и базой данных.
Развернуть

Программа

Программа "Исследования и разработки по приоритетным направлениям развития науки и техники" на 2002-2006 годы

Программное мероприятие

1.9 Проведение молодыми учеными научных исследований по приоритетным направлениям науки, высоких технологий и образования
Продолжительность работ
2012 - 2013, 17 мес.
Бюджетные средства
2,92 млн
Организация
ИППИ РАН
профинансировано
Продолжительность работ
2009 - 2011, 24 мес.
Бюджетные средства
3,06 млн
Организация
ИОГен РАН
профинансировано
Тема
Разработка, внедрение и применение интегрированного программного обеспечения, реализующего методы сравнительной геномики для функциональной аннотации генов, анализа регуляторных взаимодействий, реконструкции и моделирования метаболизма бактерий.
Продолжительность работ
2005 - 2006, 23 мес.
Бюджетные средства
6 млн
Количество заявок
2
Тема
Организация и проведение аналитических работ в рамках международных сравнительных исследований в области оценки компетенций взрослого населения Российской Федерации
Продолжительность работ
2013, 2 мес.
Бюджетные средства
5 млн
Количество заявок
2
Тема
Сравнительное популяционно-генетическое изучение широкораспространенных мультифакториальных заболеваний в популяциях EU/AC и России.
Продолжительность работ
2009 - 2012, 38 мес.
Бюджетные средства
72 млн
Количество заявок
4
Тема
Исследование сообщества микроорганизмов внутренних органов человека.
Продолжительность работ
2011 - 2012, 21 мес.
Бюджетные средства
18 млн
Количество заявок
11
Тема
Организация и проведение международных сравнительных исследований
Продолжительность работ
2011 - 2013, 29 мес.
Бюджетные средства
54,57 млн
Количество заявок
1