Проведение научных исследований молодыми учеными. Применение фазовых диаграмм для исследования металл-связывающих белков.
Стадии проекта
Предложение принято
Конкурс завершен
Выполнение этапа проекта
Проект
02.442.11.7542
Организация
ФИЦ ПНЦБИ РАН
Продолжительность работ
2006, 7 мес.
Бюджетные средства
0,4 млн
Внебюджетные средства
0 млн
Информация отсутствует
Этапы проекта
1
06.03.2006 - 31.05.2006
Краткое описание выполненных работ:
1. Разработан математический аппарат, описывающий химические равновесия по температуре и концентрации металла в системе металл-белок с одним или двумя центрами связывания иона металла (для механизма последовательного заполнения металлсвязывающих центров белка), позволяющий строить фазовые диаграммы системы в пространстве параметров температура – свободная концентрация металла.
2. Разработан пошаговый алгоритм экспериментального определения ключевых параметров математической модели исследуемой системы для типичных ситуаций, встречаемых на практике.
3. Наработаны препараты лизоцима молока лошади и парвальбумина.
4. Подобраны оптимальные экспериментальные условия для физико-химической характеризации исследуемых белков.
5. По результатам проведенных исследований подготовлена к публикации статья в рецензируемом журнале (The Protein Journal).
1. Разработан математический аппарат, описывающий химические равновесия по температуре и концентрации металла в системе металл-белок с одним или двумя центрами связывания иона металла (для механизма последовательного заполнения металлсвязывающих центров белка), позволяющий строить фазовые диаграммы системы в пространстве параметров температура – свободная концентрация металла.
2. Разработан пошаговый алгоритм экспериментального определения ключевых параметров математической модели исследуемой системы для типичных ситуаций, встречаемых на практике.
3. Наработаны препараты лизоцима молока лошади и парвальбумина.
4. Подобраны оптимальные экспериментальные условия для физико-химической характеризации исследуемых белков.
5. По результатам проведенных исследований подготовлена к публикации статья в рецензируемом журнале (The Protein Journal).
2
01.06.2006 - 02.10.2006
Целью настоящей работы является разработка и апробация на реальных системах пошаговых алгоритмов построения фазовых диаграмм для простейших систем белок-катион металла, для одноцентровых (α-лактальбумин и лизоцим лошадиного молока) и двуцентровых (парвальбумин) металл-связывающих белков.
Разработанный и успешно апробированный в настоящей работе математический аппарат является оригинальным, отвечает лучшим достижения в данной области. Помимо получения новой информации об исследуемых белках он позволяет формализовать исследования физико-химических свойств аналогичных лиганд-белковых систем, в которых в качестве лиганда выступает любое низкомолекулярное вещество, не претерпевающее химических превращений в ходе взаимодействия с белком. Это обстоятельство существенно расширяет применимость результатов исследования, позволяя распространять их на широкий круг биологически значимых молекул, включая первичные и вторичные мессенджеры, макроэргические молекулы, витамины, токсичные вещества, и пр. Учитывая, что результаты работы могут быть применимы к большому количеству биологических систем, можно рекомендовать проект для использования в уточнении технических заданий на другие НИР, рассматривающие сходные биологические системы.
Разработанный и успешно апробированный в настоящей работе математический аппарат является оригинальным, отвечает лучшим достижения в данной области. Помимо получения новой информации об исследуемых белках он позволяет формализовать исследования физико-химических свойств аналогичных лиганд-белковых систем, в которых в качестве лиганда выступает любое низкомолекулярное вещество, не претерпевающее химических превращений в ходе взаимодействия с белком. Это обстоятельство существенно расширяет применимость результатов исследования, позволяя распространять их на широкий круг биологически значимых молекул, включая первичные и вторичные мессенджеры, макроэргические молекулы, витамины, токсичные вещества, и пр. Учитывая, что результаты работы могут быть применимы к большому количеству биологических систем, можно рекомендовать проект для использования в уточнении технических заданий на другие НИР, рассматривающие сходные биологические системы.
Программа
Программа "Исследования и разработки по приоритетным направлениям развития науки и техники" на 2002-2006 годы
Программное мероприятие
1.9 Проведение молодыми учеными научных исследований по приоритетным направлениям науки, высоких технологий и образования
Исследование цинк-зависимой димеризации металл-связывающего домена природных вариантов бета-амилоида болезни Альцгеймера
профинансировано
Роль металл-связывающего домена 1-16 в патогенной агрегации бета-амилоида болезни Альцгеймера
профинансировано
Влияние химических модификаций на пространственную структуру и олигомерное состояние цинк-зависимых комплексов металл-связывающего домена бета-амилоида болезни Альцгеймера.
профинансировано
Функциональные устройства оксидной электроники на основе эффекта фазового перехода металл-изолятор
профинансировано
профинансировано