Регистрация / Вход
Прислать материал

"Геномы вирусов, про- и эукариот: новые подходы к выявлению специфических фрагментов нуклеиновых кислот в режиме реального времени и их применение в ДНК-диагностике".

Стадии проекта
Предложение принято
Конкурс завершен
Выполнение этапа проекта
Проект
02.445.11.7018
Организация
УФИЦ РАН

«Развитие системы ведущих научных школ как среды генерации знаний и подготовки научно-педагогических кадров высшей квалификации»

Этапы проекта

1
05.09.2005 - 30.11.2005
Разработано два улучшенных варианта детекции целевых продуктов в ходе ПЦР в реальном времени. Разработаны два способа ЛЦР РВ, включая относительно простой и дешевый вариант, основанный на детекции результатов за счет свечения специфичного к двуцепочечной ДНК красителя SYBR Green I (причем в ЛЦР специфичность детекции с ним выше, чем при ПЦР), регистрируемого при температуре, при которой одиночные дуплексы, неизбежно образующиеся в каждом цикле, плавятся, а двойной, представляющий собой целевой продукт - еще нет. Другим разработанным нами более дорогим, но при этом более специфичным и чувствительным способом детекции в ЛЦР-РВ, является регистрация флуоресценции, возникающей у присоединенного к одному олигонуклеотиду красителя-акцептора после переноса на него резонансной энергии от возбуждаемого красителя-донора, входящего в состав соседнего олигонуклеотида, которые в ходе ЛЦР в результате лигирования становятся единой молекулой. Показана принципиальная возможность лигирования соседних олигонуклеотидов на матрице РНК с помощью НАД-зависимой термостабильной Tth ДНК лигазой, что исключает необходимость выполнения непростого этапа по переводу РНК в ДНК-копию. Недавно предложенная новая цепная реакция - гибридизационная (ГЦР) преобразована нами в режим реального времени, где детекция роста цепей ДНК ведется по увеличивающейся флуоресценции соответствующего красителя за счет исчезновения эффекта гашения, что происходит при пошаговом удлинении цепей ДНК и разнесении за счет этого в пространстве пары молекул флуорохром/гаситель.
Показана перспективность применения предложенных нами способов ПЦР-РВ, ЛЦР-РВ и ГЦР-РВ в ДНК-диагностике различных инфекций вирусной и бактериальной природы, для выявления нежелательных примесей в сырье и готовой пищевой продукции, а также для определения уровня экспрессии различных генов на примере гена белка холодового шока капусты и генов тирозингидроксилазы и карбоксипептидазы H крысы. Созданы ДНК-диагностикумы для обнаружения хантавирусной, коронавирусной и хламидийной инфекций, а также для определения наличия примесей муки мягкой пшеницы в семолине, идущей на изготовление макаронных изделий повышенного качества и в готовой продукции.
Развернуть

Программа

Программа "Исследования и разработки по приоритетным направлениям развития науки и техники" на 2002-2006 годы

Программное мероприятие

1.12 Развитие системы ведущих научных школ как среды генерации знаний и подготовки научно-педагогических кадров высшей квалификации
Продолжительность работ
2005, 2 мес.
Бюджетные средства
1,2 млн
Организация
ИМБ РАН
профинансировано
Продолжительность работ
2005, 2 мес.
Бюджетные средства
1,2 млн
Организация
ИМГ РАН
профинансировано
Тема
Разработка новых методов изотермической амплификации нуклеиновых кислот в реальном времени и их использование в фундаментальных и прикладных исследованиях.
Продолжительность работ
2008, 3 мес.
Бюджетные средства
1,2 млн
Количество заявок
1
Тема
Развитие системы ведущих научных школ как среды генерации знаний и подготовки научно-педагогических кадров высшей квалификации. Проведение научно-исследовательских работ по приоритетным направлениям Программы
Продолжительность работ
2005 - 2006, 23 мес.
Бюджетные средства
300 млн
Количество заявок
753
Тема
Разработка технологии и создание автоматизированной системы визуализации трехмерных моделей результатов анализа и моделирования динамических процессов в режиме реального времени.
Продолжительность работ
2007 - 2008, 12 мес.
Бюджетные средства
64 млн
Количество заявок
1
Тема
Создание синтетических регуляторов активности клеточных белков на основе синтетических аналогов нуклеиновых кислот для конструирования биомедицинских препаратов и диагностикумов нового поколения.
Продолжительность работ
2008, 3 мес.
Бюджетные средства
1,2 млн
Количество заявок
2
Тема
Разработка противовирусных нанокомпозитов диоксида титана с каталитически активными нуклеиновыми кислотами.
Продолжительность работ
2009 - 2010, 17 мес.
Бюджетные средства
7 млн
Количество заявок
1