Последовательности центромера мыши и их участие в трехмерной организации хроматина. На пути к искусственной хромосоме.
Стадии проекта
Предложение принято
Конкурс завершен
Проект закончен
Проект
02.512.11.2142
Организация
ИНЦ РАН
Руководитель работ
Парфенов Владимир Николаевич
Продолжительность работ
2007, 5 мес.
Бюджетные средства
1,2 млн
Внебюджетные средства
1,45 млн
В результате выполнения каждой работы должен быть создан необходимый научно-технический задел, обеспечивающий переход к проведению опытно-конструкторских работ с целью последующей коммерциализации
Этапы проекта
1
25.06.2007 - 20.11.2007
В 2007 г. клонирован недостающий фрагмент нормального ЦЕН после ПЦР ДНК хромоцентров на праймерах, специфичных для МиСат и MS3. После получения результатов секвенирования и проверки локализации фрагмента методом fiberFISH окажется возможным собрать первый в мире полный естественный ЦЕН многоклеточного животного. Получен набор дискретных фрагментов при рестриктном анализе геномной ДНК других видов мышевидных грызунов. Проводится усовершенствование программы для поиска и сортировки тандемных повторов в базе данных Сhromosome Unknown (CHRUNTA -СHRomosome UNknown Tandem Analyzer). Программа нашла вновь клонированные MS3 и MS4, что не удавалось тривиальными методами поиска. Программой CHRUNTA на базе ChrUn предсказано более 30 больших семейств тандемных повторов, не описанных в литературе. Планируется проверить это предсказание экспериментально. Исследована локализация ЦЕН (МиСат и MS3) и периЦЕН (МаСат и MS4) последовательностей сатДНК в ядрах 1- и 2-клеточных зародышей, в том числе и обработанных окадаевой кислотой. Все 4 описанных сатДНК мыши – непременный компонент проядрышек (ПЯ). Все сатДНК гипометилированы на 1- и 2-клеточной стадиях. Обязательным компонентом большинства ПЯ являются РНК-геликаза р68 и белки когезинового и синептонемного комплекса, в то время как DICER находится вне ПЯ.
Программа
Программа "Исследования и разработки по приоритетным направлениям развития научно-технологического комплекса России на 2007-2013 годы"
Программное мероприятие
1.2 Проведение проблемно-ориентированных поисковых исследований и создание научно-технического задела по технологиям в области наук о жизни
профинансировано
профинансировано
профинансировано
профинансировано
Продолжительность работ
2007, 5 мес.
Бюджетные средства
1,2 млн
Организация
ГУНУ ФФМ МГУ имени М.В. Ломоносова
профинансировано