Последовательности центромера мыши и их участие в трехмерной организации хроматина. На пути к искусственной хромосоме.

В 2007 г. клонирован недостающий фрагмент нормального ЦЕН после ПЦР ДНК хромоцентров на праймерах, специфичных для МиСат и MS3. После получения результатов секвенирования и проверки локализации фрагмента методом fiberFISH окажется возможным собрать первый в мире полный естественный ЦЕН многоклеточного животного. Получен набор дискретных фрагментов при рестриктном анализе геномной ДНК других видов мышевидных грызунов. Проводится усовершенствование программы для поиска и сортировки тандемных повторов в базе данных Сhromosome Unknown (CHRUNTA -СHRomosome UNknown Tandem Analyzer). Программа нашла вновь клонированные MS3 и MS4, что не удавалось тривиальными методами поиска. Программой CHRUNTA на базе ChrUn предсказано более 30 больших семейств тандемных повторов, не описанных в литературе. Планируется проверить это предсказание экспериментально. Исследована локализация ЦЕН (МиСат и MS3) и периЦЕН (МаСат и MS4) последовательностей сатДНК в ядрах 1- и 2-клеточных зародышей, в том числе и обработанных окадаевой кислотой. Все 4 описанных сатДНК мыши – непременный компонент проядрышек (ПЯ). Все сатДНК гипометилированы на 1- и 2-клеточной стадиях. Обязательным компонентом большинства ПЯ являются РНК-геликаза р68 и белки когезинового и синептонемного комплекса, в то время как DICER находится вне ПЯ.