Регистрация / Вход
Прислать материал

Разработка метода компьютерного моделирования структур макромолекул на основе рентгеноструктурных данных.

Стадии проекта
Предложение принято
Конкурс завершен
Проект закончен
Проект
02.513.11.3388
Организация
НИЦ "Курчатовский институт"
Руководитель работ
Поляков Константин Михайлович
Продолжительность работ
2008, 3 мес.
Бюджетные средства
3 млн
Внебюджетные средства
0 млн
Конкурс
Разработка метода компьютерного моделирования структур макромолекул на основе рентгеноструктурных данных.

Разработка метода компьютерного моделирования структур макромолекул на основе полноматричного метода наименьших квадратов, основанного на оригинальном алгоритме. Метод будет реализоан в виде программного продукта, обеспечивающего все преимущества использования полноматричной схемы уточнения структур макромолекул.

Этапы проекта

1
19.08.2008 - 30.11.2008
В ходе выполнения работ по проекту № 02.513.11.3388 был разработан алгоритм неявного умножения матрицы на вектор с использованием быстрого Фурье-преобразования. На базе этого алгоритма создана версия программы FMLSQ для уточнения по методу наименьших квадратов. Программа содержит около 100 000 линий кода на языках программирования ФОРТРАН 95 и С. Программа отлаживалась и тестировалась как на небольших искусственных трехатомных структурах, так и на реальных структурах макромолекул размер которых достигал 132 000 атомов.
В процессе разработки показана принципиальная возможность использования программы для расчетов ошибок (стандартных отклонений) параметров модели для структур практически любого размера.
Создана первая версия инструкции для потенциальных пользователей предварительной версии программы.
Рассчитаны необходимые производные для введения в расчеты стереохимических ограничений необходимые для создания окончательной версии программы.
Развернуть

Программа

Программа "Исследования и разработки по приоритетным направлениям развития научно-технологического комплекса России на 2007-2013 годы"

Программное мероприятие

1.3 Проведение проблемно-ориентированных поисковых исследований и создание научно-технического задела в области индустрии наносистем
Похожие проекты Похожие конкурсы
Создание программных средств и расчетных методов компьютерного моделирования физико-механических процессов и наноструктурирования в сталях с нестационарной структурой при термонагружении
Продолжительность работ
2009 - 2010, 11 мес.
Бюджетные средства
14,75 млн
Организация
МГТУ им. Н.Э.Баумана
профинансировано
Программный комплекс для расшифровки пространственной структуры и молекулярного моделирования мембранных белков и пептидов на основе анализа и интеграции экспериментальных данных, получаемых с помощью новейших методов электронной микроскопии и рентгеноструктурного анализа.
Продолжительность работ
2012 - 2013, 13 мес.
Бюджетные средства
10 млн
Организация
ФГАОУ ВО СВФУ "Северо-Восточный федеральный университет имени М.К. Аммосова"; Северо-Восточный федеральный университет; СВФУ
профинансировано
Исследование и разработка технологии суперкомпьютерного молекулярного моделирования на базе реконфигурируемых вычислительных систем.
Продолжительность работ
2008 - 2009, 15 мес.
Бюджетные средства
12 млн
Организация
НИВЦ МГУ им. М.В. Ломоносова
профинансировано
Разработка интерактивной Веб-ориентированной системы для решения задач молекулярного моделирования с использованием технологий распределенных вычислений.
Продолжительность работ
2005 - 2006, 14 мес.
Бюджетные средства
8,5 млн
Организация
НИВЦ МГУ им. М.В. Ломоносова
профинансировано
Создание программно-вычислительного комплекса для компьютерного моделирования взаимодействия углеродных нанотрубок с водородом
Продолжительность работ
2014 - 2016, 26 мес.
Бюджетные средства
15,96 млн
Организация
НИТУ "МИСиС", МИСиС
профинансировано
Разработка метода компьютерного моделирования структур макромолекул на основе рентгеноструктурных данных.
Тема
Разработка метода компьютерного моделирования структур макромолекул на основе рентгеноструктурных данных.
Продолжительность работ
2008, 3 мес.
Бюджетные средства
3 млн
Количество заявок
2
Создание программных средств и расчетных методов компьютерного моделирования физико-механических процессов и наноструктурирования в сталях с нестационарной структурой при термонагружении.
Тема
Создание программных средств и расчетных методов компьютерного моделирования физико-механических процессов и наноструктурирования в сталях с нестационарной структурой при термонагружении.
Продолжительность работ
2009 - 2010, 12 мес.
Бюджетные средства
15 млн
Количество заявок
2
Исследование и разработка технологии суперкомпьютерного молекулярного моделирования на базе реконфигурируемых вычислительных систем.
Тема
Исследование и разработка технологии суперкомпьютерного молекулярного моделирования на базе реконфигурируемых вычислительных систем.
Продолжительность работ
2008 - 2009, 16 мес.
Бюджетные средства
12 млн
Количество заявок
2
Разработка и экспериментальная валидация программных комплексов дизайна внутренней структуры материалов и покрытий и многоуровневого компьютерного моделирования элементов конструкций из наноструктурных материалов на металлической и керамической основе, совместимых с коммерческими системами проектирования и моделирования
Тема
Разработка и экспериментальная валидация программных комплексов дизайна внутренней структуры материалов и покрытий и многоуровневого компьютерного моделирования элементов конструкций из наноструктурных материалов на металлической и керамической основе, совместимых с коммерческими системами проектирования и моделирования
Продолжительность работ
2017 - 2018, 14 мес.
Бюджетные средства
58 млн
Количество заявок
3
Разработка интерактивной Веб-ориентированной системы для решения задач молекулярного моделирования с использованием технологий распределенных вычислений.
Тема
Разработка интерактивной Веб-ориентированной системы для решения задач молекулярного моделирования с использованием технологий распределенных вычислений.
Продолжительность работ
2005 - 2006, 23 мес.
Бюджетные средства
10 млн
Количество заявок
2