Регистрация / Вход
Прислать материал

Разработка методологических основ создания информационного и программного обеспечения для анализа функционального эффекта полиморфизма белков человека, полученного из индивидуальных геномов

Стадии проекта
Предложение принято
Конкурс завершен
Проект закончен
Проект
02.514.12.4007
Организация
ИМБ РАН
Руководитель работ
Туманян Владимир Гайевич

Cоздание специального прикладного программного обеспечения (ППО), включающего базы данных полиморфизмов белков человека и программные блоки для анализа их функциональности (влияния на фенотип через воздействие на функцию или структуру белков).

Соисполнители

Организация
ИППИ РАН

Участники проекта

Зам. руководителя работ
Раменский Василий Евгеньевич

Этапы проекта

1
24.09.2009 - 15.11.2009
Проведен анализ научно-технической литературы, нормативно-технической документации и других материалов, относящихся к теме работ. Разработана концепция создания ИПК для анализа полиморфизмов белков человека, полученных из индивидуальных геномов, с оценкой их потенциальной функциональности. Разработана архитектура БД.
Развернуть
2
16.11.2009 - 31.12.2009
Разработаны методы анализа семейства белков, связывающих малые молекулы-субстраты, с целью выявления групп и позиций специфичности, алгоритмы для корреляционного анализа позиций в семействах белков, в том числе связывающих молекулы ДНК и другие белки, алгоритмы для построения позиционных весовых профилей в семействах белков с учетом специфичности, методы для анализа функциональности несинонимичных полиморфизмов в белках.
Развернуть
3
01.01.2010 - 30.04.2010
Разработаны программные модули, в том числе: для анализа семейств белков, связывающих малые молекулы-субстраты, молекулы ДНК и другие белки; выявления групп и позиций специфичности и построения позиционных весовых профилей; корреляционного анализа позиций в семействах белков; аннотации семейств белков. Также разработаны программные модули и модули БД, в том числе: модуля БД для хранения информации о полиморфизмах из индивидуальных геномов; для аннотации функционального эффекта полиморфизмов. Разработан пользовательский интерфейс к ПО и БД.
Развернуть
4
01.05.2010 - 15.09.2010
Разработаны рекомендации по использованию результатов проведенной НИР. Проведена технико-экономическая оценка рыночного потенциала полученных результатов. Разработан проект ТЗ на выполнение ОКР. Реализованы мероприятия по достижению технико-экономических показателей.
Развернуть

Программа

Программа "Исследования и разработки по приоритетным направлениям развития научно-технологического комплекса России на 2007-2013 годы"

Программное мероприятие

1.4 Проведение проблемно-ориентированных поисковых исследований и создание научно-технического задела по перспективным технологиям в области информационно-телекоммуникационных систем
Тема
Разработка методологических основ создания информационного и программного обеспечения для анализа функционального эффекта полиморфизма белков человека, полученного из индивидуальных геномов.
Продолжительность работ
2009 - 2010, 14 мес.
Бюджетные средства
8 млн
Количество заявок
1
Тема
Разработка аппаратно-программного комплекса для определения и коррекции психофизиологического и функционального состояния человека-оператора методом аудиовизуального воздействия с применением динамически управляемого полупроводникового источника света.
Продолжительность работ
2009 - 2010, 17 мес.
Бюджетные средства
7 млн
Количество заявок
4
Тема
Индивидуальная чувствительность генома и особенности проявления генотоксических эффектов у людей, длительно подвергающихся воздействию повышенных концентраций радона. Изучение возможных механизмов модификации эффектов.
Продолжительность работ
2008 - 2009, 17 мес.
Бюджетные средства
7,8 млн
Количество заявок
2
Тема
Изучение взаимосвязи активности мозга с индивидуальными особенностями человека на молекулярно-генетическом уровне.
Продолжительность работ
2008 - 2009, 17 мес.
Бюджетные средства
7,8 млн
Количество заявок
2
Тема
Разработка методов получения адаптивных композиционных наноматериалов с изменяющимися под воздействием внешних факторов функциональными свойствами
Продолжительность работ
2014 - 2016, 26 мес.
Бюджетные средства
64,8 млн
Количество заявок
24