Регистрация / Вход
Прислать материал

«Создание высокоэффективных флуоресцентномеченых дезоксинуклеозидтрифосфатов для высокочувствительных методов ПЦР - диагностики»

Стадии проекта
Предложение принято
Конкурс завершен
Проект закончен
Проект
02.740.11.0080
Организация
ИМБ РАН

Информация отсутствует

Этапы проекта

1
15.06.2009 - 15.10.2009
На этапе №1 (15 июня 2009 г. - 15 октября 2009 г.) в соответствии с требованиями Технического задания и Календарного плана, выполнены следующие работы:
1) осуществлен выбор схем синтеза флуоресцентно-меченых дезоксинуклеозидтрифосфатов;
2) Подобраны и экспериментально апробированы описанные в литературе методики получения целевых и промежуточных соединений, необходимых для выполнения НИР;
3) выполнен синтез 5-аминоаллил-2`-дезоксиуридин-5`-трифосфата;
4) проведены патентные исследования в соответствии с ГОСТ Р 15.011-96;
5) осуществлен синтез 1-этил-2,3,3-триметилиндолениний иодида;
6) подготовлены материалы для внедрения результатов НИР в образовательный процесс МИТХТ;
7) проведен анализ литературных данных по зависимости спектральных характеристик цианиновых красителей от их структуры и изучение спектральных свойств модельных соединений. Выбраны оптимальные структуры цианиновых красителей;
8) подготовлены материалы для внедрения результатов НИР в образовательный процесс МФТИ;
9) осуществлен синтез 1-(5-карбоксипентил)-2,3,3—триметилиндолениний бромида.
Развернуть
2
16.10.2009 - 10.12.2009
На этапе №2 (16 октября 2009 г. - 10 декабря 2009 г.) в соответствии с требованиями Технического задания и Календарного плана, выполнены следующие работы:
1) осуществлен синтез флуоресцентного цианинового красителя 1-(5-карбоксипентил)-1`-этил-3,3,3`,3`-тетраметилиндодикарбоцианина.
2) осуществлен синтез флуоресцентно-меченого производного дезоксиуридинтрифосфата - конъюгата 5-аминоаллил-2`-дезоксиуридин-5`-трифосфата и 1-(5-карбоксипентил)-1`-этил-3,3,3`,3`-тетраметилиндодикарбоцианина;
3) разработана методика и критерии оценки эффективности применения флуоресцентно-меченого нуклеозидтрифосфата в ПЦР-диагностике на примере анализа точечных мутаций штаммов Mycobacterium tuberculosis;
4) выполнен синтез 1-этил-2,3,3-триметил-5-сульфоиндолениния; подготовлены материалы для внедрения результатов НИР в образовательный процесс МИТХТ;
5) исследованы спектральные свойства красителя 1-(5-карбоксипентил)-1`-этил-3,3,3`,3`-тетраметилиндодикарбоцианина и его конъюгата с 5-аминоаллил-2`-дезоксиуридин-5`-трифосфатом; подготовлены материалы для внедрения результатов НИР в образовательный процесс МФТИ;
6) выполнен синтез 1-(5-карбоксипентил)-2,3,3-триметил-5-сульфоиндолениния.
Развернуть
3
01.01.2010 - 15.07.2010
3.1. Синтез не менее четырех водорастворимых
цианиновых красителей с сульфогруппой в
положении Г, 5'или 5 и карбоксипентильной
группой в положении 1 индоленинового фрагмента
красителя.
3.2. Синтез флуоресцентно-меченых трифосфатов
дезоксиуридина на основе синтезированных
красителей.
3.3. Экспериментальная оценка эффективности
применения синтезированных соединений в ПЦР-
диагностике при анализе точечных мутаций
штаммов МусоЬас1епит 1иЪегси1ош и для анализа
однонуклеотидного полиморфизма генома
человека.
3.4. Синтез 1-сульфобутил-2,3,3-
триметилиндолениния. Подготовка материалов для
внедрения результатов НИР в образовательный
процесс МИТХТ.
3.5. Исследование спектральных свойств
полученных конъюгатов красителей с
карбоксипентильным заместителем в положении 1
и 5-аминоаллил-2'-дезоксиуридин-5'-
трифосфатом. Подготовка материалов для
внедрения результатов НИР в образовательный
процесс МФТИ.
3.6. Синтез 4-(2-карбоксиэтил)-фенилгидразина
гидрохлорида.
Развернуть
4
16.07.2010 - 10.12.2010
4.1. Синтез не менее трёх водорастворимых
цианиновых красителей с сульфогруппой в
положении 1, Г или 5' и карбоксиэтильной
группой в 5 положении индоленинового фрагмента
красителя.
4.2. Синтез флуоресцентно-меченых трифосфатов
дезоксиуридина на основе синтезированных
красителей.
4.3. Экспериментальная оценка эффективности
применения синтезированных соединений в ПЦР-
диагностике при анализе точечных мутаций
штаммов МусоЪас1епит 1иЬегси1о515 и для анализа
однонуклеотидного полиморфизма генома
человека.
4.4. Синтез 1-сульфобутил-2,3,3-триметил-5-(2-
карбоксиэтил)-индолениния. Подготовка
материалов для внедрения результатов НИР в
образовательный процесс МИТХТ.
4.5. Исследование спектральных свойств
полученных конъюгатов красителей с
карбоксиэтильной группой в положении 5 с 5-
аминоаллил-2'-дезоксиуридин-5'-трифосфатом.
Подготовка материалов для внедрения результатов
НИР в образовательный процесс МФТИ.
4.6. Синтез 1-этил-2,3,3-триметил-5-(2-
карбоксиэтил)-индолениния иодида
Развернуть
5
01.01.2011 - 15.07.2011
5.1. Синтез не менее трёх водорастворимых
цианиновых красителей с сульфогруппой в
положении 1, Г, 5 или 5 и карбоксибутильной
группой в 3 положении индоленинового фрагмента
красителя.
5.2. Синтез флуоресцентно-меченых трифосфатов
дезоксиуридина на основе синтезированных
красителей.
5.3. Экспериментальная оценка эффективности
применения синтезированных соединений в ПЦР-
диагностике при анализе точечных мутаций
штаммов Mycobacterium tuberculosis и для анализа
однонуклеотидного полиморфизма генома
человека.
5.4. Синтез 6-метил-7-оксооктановой кислоты.
5.5. Синтез 3-(4-карбоксибутил)-2,3-
диметюшндоленина.
5.6. Синтез 3-(4-карбоксибутил)-2,3-диметил-1-
этилиндолениния иодида. Подготовка материалов
для внедрения результатов НИР в
образовательный процесс МИТХТ.
5.7. Исследование спектральныхсвойств
полученных конъюгатов красителей с
карбоксиэтильной группой в положении 5 с 5-
аминоаллил-2"-дезоксиуридин-5'-трифосфатом.
Подготовка материалов для внедрения результатов
НИР в образовательный процесс МФТИ.
5.8. Синтез 3-(4-карбоксибутил)-2,3-диметил-1-
сульфобутилиндолениния.
Развернуть
6
16.07.2011 - 05.09.2011
6.1. Оптимизация процедур амплификации с
использованием флуоресцентно-меченых
дезоксиуридинтрифосфатов.
6.2. Выбор оптимальных соединений по
результатам оценки эффективности встраивания
флуоресцентно-меченых
дезоксиуридинтрифосфатов в ходе ПЦР.
6.3. Оценка возможности создания
конкурентоспособной продукции и услуг и
разработка рекомендаций по использованию
результатов проведенных НИР.
6.4. Оптимизация методик синтеза, процедур
выделения и очистки производных 2,3,3-
триметилиндоленина. Разработка программы
внедрения результатов НИР в образовательный
процесс МИТХТ
6.5. Изучение возможности применения
флуоресцентно-меченых нуклеозидтрифосфатов
для решения медико-биологических задач.
Разработка программы внедрения результатов
НИР в образовательный процесс МФТИ.
6.6. Оптимизация процедур выделения и очистки
производных 2,3 ,3-триметил-5-сульфоиндоленина.
Развернуть

Программа

Программа "Научные и научно-педагогические кадры инновационной России" на 2009 - 2013 годы

Программное мероприятие

1.1 Проведение научных исследований коллективами научно-образовательных центров
Продолжительность работ
2012 - 2013, 10 мес.
Бюджетные средства
0,58 млн
профинансировано
Тема
Разработка новых высокоинформативных, высокочувствительных методов и средств лазерного мониторинга гидросферы.
Продолжительность работ
2005 - 2006, 23 мес.
Бюджетные средства
6 млн
Количество заявок
5
Тема
Разработка и исследование наноматериалов для современных высокочувствительных методов анализа различных объектов.
Продолжительность работ
2013, 6 мес.
Бюджетные средства
50 млн
Количество заявок
40
Тема
Разработка высокочувствительных фотоэлектронных умножителей, чувствительных в диапазоне от УФ до ближнего ИК излучения
Продолжительность работ
2014 - 2016, 29 мес.
Бюджетные средства
48,3 млн
Количество заявок
0
Тема
Разработка технологии изготовления высокочувствительных гибридных полупроводниковых наноструктур для детектирования жидкостей и газов при температуре окружающей среды.
Продолжительность работ
2008 - 2010, 23 мес.
Бюджетные средства
25 млн
Количество заявок
1
Тема
Разработка высокочувствительных биолюминесцентных тестеров нового поколения для экспресс-контроля микробных загрязнений в медицине, сельском хозяйстве и различных отраслях промышленности.
Продолжительность работ
2005 - 2006, 23 мес.
Бюджетные средства
8 млн
Количество заявок
2