Регистрация / Вход
Прислать материал

«Разработка систем ДНК-идентификации и оценка
геномного полиморфизма вирусов и животных - объектов ветеринарного и
медицинского значения»

Стадии проекта
Предложение принято
Конкурс завершен
Проект закончен
Проект
02.740.11.0088
Организация
ИБГ РАН
Руководитель работ
Рысков Алексей Петрович

Информация отсутствует

Этапы проекта

1
15.06.2009 - 30.11.2009
В соответствии с заданием, предусмотренным пунктом 1.1 календарного плана, из образцов Fasciola hepatica выделена ДНК и проведено изучение структурных особенностей и полиморфизма длинного (LNR) и короткого (SNR) некодирующих участков митохондриального генома печеночного сосальщика Fasciola hepatica из нескольких популяций России и Беларуси. Показано, что амплификация LNR приводит к образованию набора из 9 фрагментов, различающихся между собой на длину тандемного повтора (85 п. н).
В соответствии с заданием, предусмотренным пунктом 1.2 календарного плана, из образцов Fasciola gigantica выделена ДНК и определена структура короткого некодирующего участка митохондриального генома у представителей Fasciola gigantica из различных популяций России, Узбекистана и Туркмениcтана. Показано, что различие связано с возникновением у ряда особей трансверсии t→g в положении 21.
В соответствии заданием, предусмотренным пунктом 1.3 календарного плана, выявлены аллельные варианты локусов Du281 и Du47, установлена их молекулярная структура и проведен сравнительный анализ аллелей у представителей однополых и двуполых видов ящериц рода Darevskia. Разработана математическая модель для качественной и количественной оценки встречаемости аллельных вариантов локуса Du214 в генофонде однополого вида D.unisexualis.
В соответствии заданием, предусмотренным пунктом 1.4 календарного плана, получены и охарактеризованы генные конструкции, содержащие в качестве вектора ДНК вируса осповакцины и гены вируса бычьего иммунодефицита gag (W-65-BIVgag) и pol (W-65-BIVpol) под контролем ранне-позднего синтетического поксвирусного промотора.
В соответствии заданием, предусмотренным пунктом 1.5 календарного плана, получены первичные клеточные культуры человека. Для целей геномной паспортизации использован метод ПЦР со случайными праймерами. ИЗ 27 тестированных отобрано 3 праймера, дающих наиболее информативные спектры маркеров, обладающие индивидуальной специфичностью.
Развернуть
2
01.01.2010 - 30.06.2010
В соответствии заданием, предусмотренным пунктом 2.1 календарного плана, выявлены и охарактеризованы полиморфные участки генома 4-х видов птичьих шистосом (сем. Schistosomatidae). Полиморфизм участка митохондриального гена cox1 (810 п.н.) изучен среди 15 церкариальных изолятов птичьих шистосом (сем. Schistosomatidae), собранных из водоемов Москвы и Московской области и принадлежащих к трем видам из рода Trichobilharzia: T. szidati, T. franki и T. regenti.
В соответствии заданием, предусмотренным пунктом 2.2 календарного плана, проведены патентные исследования. Для оценки патентоспособности объекта исследования, были проанализированы патентные документы, касающиеся способа определения видовой принадлежности птичьих шистосом. Не обнаружено опубликованных патентных документов, в которых указывался бы способа определения видовой принадлежности птичьих шистосом. Поэтому рекомендуется подать заявку на изобретение РФ по исследуемому объекту поиска (Форма Д.2.2).
В соответствии заданием, предусмотренным пунктом 2.3 календарного плана, проведено выделение и очистка белков вируса бычьего иммунодефицита (ВБИ) - продуктов генов evn, gag и pol. Создана методическая база для проведения этой работы (разработка иммунофермент-ного метода для выявления белков ВБИ, разработка метода очистки белков этого вируса, индуцированных рекомбинантными вирусами в культуре клеток).
В соответствии заданием, предусмотренным пунктом 2.4 календарного плана, получены и охарактеризованы рекомбинанты вирусов оспо-вакцины, экспрессирующие белки - продукты ген env вирусов бычьего лейкоза (ВБЛ) под контролем ранне-поздних природного и синтетического поксвирусных промоторов.
Развернуть
3
01.07.2010 - 30.11.2010
В соответствии заданием, предусмотренным пунктом 3.1 календарного плана, проведен анализ генетических и физико-химических характеристик микросателлитных локусов.
В соответствии заданием, предусмотренным пунктом 3.2 календарного плана, проведен филогеографический анализ двух видов печеночных сосальщиков (Fasciola hepatica и Fasciola gigantica) на территории Евразии.
Развернуть
4
01.01.2011 - 30.06.2011
4.1. Выявление и характеристика специфичных участков генома нескольких видов печеночных (Fasciola hepatica и Fasciola gigantica) и кровяных (сем. Schistosomatidae, сем. Sangunicolidae) сосальщиков.
4.2. Выделение и очистка белков ВБЛ-продукта гена env с использованием HPLC-хроматографии и масс-спектрометрии.
4.3. Технико-
экономическая оценка
полученных результатов.
Развернуть
5
01.07.2011 - 01.10.2011
1. Выделена ДНК и изучена нестабильность некодирующего участка митохондриального генома печеночного сосальщика Fasciola hepatica.
2. Выделена ДНК и изучена нестабильность некодирующего участка митохондриального генома печеночного сосальщика Fasciola gigantica.
3. Выделена ДНК, проведен анализ полиморфизма и молекулярной структуры ди-, три- и тетрамикросателлитных локусов геномов однополых и двуполых видов позвоночных (рептилий).
4. Выявлены и охарактеристеризованы полиморфные участки ядерного генома церкариальных изолятов четырех видов птичьих шистосом (сем. Schistosomatidae).
5. Проведены патентные исследования.
6. Получены молекулярно-генетические и физико-химические характеристики трех микросателлитных локусов (Du214, Du281 и Du183) генома партеногенетической ящерицы Darevskia unisexualis.
7. С помощью митохондриальных маркеров - генов nad1 и cox1 проведен филогеографический анализ двух видов печеночных сосальщиков (Fasciola hepatica и Fasciola gigantica) на территории Евразии, и показано наличие нескольких генеалогических линий разного происхождения.
8. Выявлены и охарактеризованы специфичные участки генома нескольких видов печеночных (Fasciola hepatica и Fasciola gigantica) и кровяных (сем. Schistosomatidae, сем. Sangunicolidae) сосальщиков.
9. Определена природа геномной вариабельности по данным анализа микросателлитных локусов разного типа у возбудителей гельминтозов и позвоночных животных.
10. Разработана молекулярно-диагностическая тест-система для видовой идентификации и детекции на разных стадиях жизненного цикла возбудителей кожного дерматита человека и животных.
Развернуть

Программа

Программа "Научные и научно-педагогические кадры инновационной России" на 2009 - 2013 годы

Программное мероприятие

1.1 Проведение научных исследований коллективами научно-образовательных центров
Продолжительность работ
2007, 5 мес.
Бюджетные средства
1,2 млн
Организация
ИБГ РАН
профинансировано
Тема
Разработка методов генетической паспортизации и создание молекулярных тест-систем у животных - объектов сельскохозяйственного и медико-ветеринарного назначения.
Продолжительность работ
2008, 3 мес.
Бюджетные средства
1,2 млн
Количество заявок
5
Тема
НК-390П Проведение поисковых научно-исследовательских работ по направлениям: «Нанотехнологии и наноматериалы», «Создание биосовместимых материалов», «Геномные и постгеномные технологии создания лекарственных средств», «Биомедицинские и ветеринарные технологии жизнеобеспечения и защиты человека и животных», «Биокаталитические, биосинтетические и биосенсорные технологии», «Клеточные технологии», «Биоинженерия» в рамках мероприятия 1.3.2 Программы
Продолжительность работ
2009 - 2010, 13 мес.
Бюджетные средства
0 млн
Количество заявок
41
Тема
НК-438П Проведение поисковых научно-исследовательских работ по направлениям: «Металлургические технологии», «Нанотехнологии и наноматериалы», «Биоинформационные технологии», «Биомедицинские и ветеринарные технологии жизнеобеспечения и защиты человека и животных», «Биоинженерия», «Создание биосовместимых материалов», «Геномные и постгеномные технологии создания лекарственных средств» в рамках мероприятия 1.3.1 Программы
Продолжительность работ
2009 - 2011, 25 мес.
Бюджетные средства
0 млн
Количество заявок
27
Тема
Проведение научных исследований научными группами под руководством докторов наук в следующих областях: - биокаталитические, биосинтетические и биосенсорные технологии; - биомедицинские и ветеринарные технологии жизнеобеспечения и защиты человека и животных; - геномные и постгеномные технологии создания лекарственных средств; - клеточные технологии; - биоинженерия; - биоинформационные технологии
Продолжительность работ
2011 - 2013, 30 мес.
Бюджетные средства
0 млн
Количество заявок
117
Тема
Проведение научных исследований научными группами под руководством кандидатов наук в следующих областях: - биокаталические, биосинтетические и биосенсорные технологии; - биомедицинские и ветеринарные технологии жизнеобеспечения и защиты человека и животных; - геномные и постгеномные технологии создания лекарственных средств; - клеточные технологии; - биоинженерия; -биоинформационные технологии
Продолжительность работ
2011 - 2013, 29 мес.
Бюджетные средства
0 млн
Количество заявок
114