«Разработка новых диагностических технологий на
основе механизмов эпигенетической регуляции»

Стадии проекта

Предложение принято

Конкурс завершен

Проект закончен

Проект

02.740.11.0089

Организация

ФГАОУ ВО Первый МГМУ им.И.М.Сеченова Минздрава России (Сеченовский Университет)

Руководитель работ

Пальцев Михаил Александрович

Продолжительность работ

2009 - 2011, 28 мес.

Бюджетные средства

13,35 млн

Внебюджетные средства

2,67 млн

Конкурс

«Проведение научных исследований коллективами научно-образовательных центров в области биомедицинских и ветеринарных технологий жизнеобеспечения и защиты человека и животных»

Информация отсутствует

Участники проекта

Зам. руководителя работ

Аксенова Елена Ивановна

Этапы проекта

15.06.2009 - 30.09.2009

1.1. Разработка протокола оптимизации
метода метилчувствительного
фингерпринтинга для скрининга аномально
метилированных фрагментов геномной ДНК.
1.2. Разработка метода идентификации
выявляемых дифференциально
метилированных локусов генома.
Работы, выполняемые за счет внебюджетных
средств
1.3. Составление обзора научных
информационных источников (статьи в
ведущих зарубежных и (или) российских
научных журналах, монографии и (или)
патенты) по тематике исследуемой
проблемы за период 1998-2008 гг. (не менее
30 научно-информационных источников) для
обоснования определения оптимального
варианта направления исследований.
1.4. Характеристика структурно-
функционального состава репрезентаций
генома, генерируемых методом
метилчувствительного фингерпринтинга.

01.10.2009 - 10.12.2009

2.1. Идентификация новых генов,
вовлеченных в канцерогенез и
подверженных эпигенетической регуляции в
соответствии с протоколами пп. 1.1. и 1.2.
2.2. Оценка частот метилирования
выявленных дифференциально
метилированных локусов при раке.
Работы, выполняемые за счет внебюджетных
средств
2.3. Разработка тест-систем для анализа
метилирования выявленных
дифференциально метилированных локусов
генома.
2.4. Оценка уровней нормального
метилирования выявленных
дифференциально метилированных локусов
генома.

01.01.2010 - 31.05.2010

3.1. Анализ С,G-состава
последовательностей изучаемых генов и
определение потенциально
диагностически ценных коровых и
некоровых СрG-островков.
3.2. Характеристика метилирования
коровых и некоровых СрG-островков
новых генов, вовлеченных в
канцерогенез.
3.3. Составление детальных карт
метилирования СрG-островков.

01.06.2010 - 10.12.2010

4.1. Определение профиля метилирования
диагностически наиболее перспективных
генов, вовлеченных в канцерогенез, в
различных типах опухолей.
4.2. Определение диагностической
ценности (чувствительность и
специфичность) выявленных элементов
эпигенетической патологии генома как
маркеров канцерогенеза.
Работы, выполняемые за счет
внебюджетных средств
4.3. Формирование аннотированной
выборки биологического материала для
проведения работ по определению
профилей метилирования в различных
типах опухолей и определения
диагностической ценности новых
маркеров метилирования.
4.4. Разработка экономичных тест-систем
на основе мультилокусной
метилчувствительной ПЦР для
одновременного анализа нескольких
маркеров метилирования, в том числе
закупка расходных материалов для
выполнения работ

01.01.2011 - 31.05.2011

5.1. Составление схемы чипа для
определения метилирования генов,
вовлеченных в канцерогенез.
5.2. Отработка условий подготовки пробы
биологического материала для анализа.
5.3. Отработка условий гибридизации
пробы биологического материала.
за Работы, выполняемые счет
внебюджетных средств.
5.4. Разработка систем зондов для
нанесения на чип, в том числе закупка
расходных материалов для выполнения
работ
5.5. Разработка метода и протокола
визуализации гибридизационного сигнала.
5.6. Разработка программного обеспечения
для визуализации и анализа результатов

01.06.2011 - 10.10.2011

6.1. Создание набора реактивов и
расходных материалов для подготовки
проб биологического материала.
6.2. Создание лабораторных образцов
биологического микрочипа низкой
плотности
6.3. Анализ образцов клинического
материала .
Работы, выполняемые за счет
внебюджетных средств
6.4. Разработка ТЭО рыночного
потенциала полученных результатов.
6.5. Разработка ТЗ на ОКР.