Регистрация / Вход
Прислать материал

Коэволюция генома и фенома человека: генетическое разнообразие популяций и фенотипическая вариабельность синтропных признаков

Стадии проекта
Предложение принято
Конкурс завершен
Проект закончен
Проект
02.740.11.0284
Организация
Томский НИМЦ
Руководитель работ
Пузырев Валерий Павлович
Продолжительность работ
2009 - 2011, 25 мес.
Бюджетные средства
11,7 млн
Внебюджетные средства
2,34 млн

Информация отсутствует

Этапы проекта

1
07.07.2009 - 30.09.2009
Проведен анализ научно-технической литературы, баз данных и интернет ресурсов по основным направлениям исследования, включая рассмотрение современного состояния проблемы. Сформированы списки генетических маркеров для последующего генотипирования по условно-нейтральным маркерам (Y-хромосома, мтДНК, Х-хромосома) и по локусам с функциональной значимостью, охватывающим различные метаболические и гомеостатические системы. Для выбранных генов подобраны tagSNP – наиболее информативные полиморфные точки в пределах изучаемых локусов генома. Проведен анализ взаимосвязи фенотипических признаков и формирование набора фенотипических маркеров для дальнейшего анализа
Развернуть
2
01.10.2009 - 12.12.2009
Проведен подбор условий генотипирования для генетических маркеров, перечень которых сформирован в результате выполнения первого этапа проекта. В качестве методов генотипирования, в зависимости от локуса, выбраны анализ полиморфизма сайтов рестрикции, ПЦР в реальном времени, аллель-специфичная ПЦР, секвенирование ПЦР-продуктов. Проведен сбор материала для исследования: сформированы выборки индивидов различного этнического происхождения (русские, тувинцы, буряты, якуты), а также выборки индивидов с сердечно-сосудистыми заболеваниями (ишемическая болезнь сердца, инфаркт миокарда, артериальная гипертензия). В группе больных проведено измерение количественных эндофенотипов (эхокардиографическое обследование, показатели липидного спектра в сыворотке крови).
Развернуть
3
01.01.2010 - 30.06.2010
3.1. Генотипирование нейтральных
маркеров популяционных выборках
с помощью ПЦР-ПДРФ анализа;
3.2. Генотипирование нейтральных
маркеров популяционных выборках
с помощью автоматического
фрагментного анализа;
3.3. Анализ частот генотипов,
аллелей и гаплотипов в
популяционных выборках.
3.4. Секвенирование некоторых
маркеров У-хромосомы и
митохондриальной ДНК в
популяционных выборках на
платформе Аpplied Вiosystems.
Развернуть
4
01.07.2010 - 12.12.2010
4.1. Анализ полиморфизма генов-
кандидатов синтропных признаков
сердечно-сосудистой системы в
популяциях коренных этносов
Сибири различного этнического
происхождения;
4.2. Анализ полиморфизма генов-
кандидатов синтропных признаков
сердечно-сосудистой системы в
городских популяциях Сибири;
4.3. Выявление ассоциаций
генетических маркеров с
синтропными заболеваниями
сердечно-сосудистой системы.
4.4. Генотипирование полиморфизма
генов-кандидатов синтропных
признаков сердечно-сосудистой
системы в выборках индивидов с
измеренными фенотипами.
Развернуть
5
01.01.2011 - 30.04.2011
Оценка статуса метилирования ряда генов методами метил-чувствительной ПЦР;
Оценка статуса метилирования ряда генов методами анализа на биочипах;
Анализ взаимосвязи статуса метилирования с фенотипами болезней сердечно-сосудистой системы
Развернуть
6
01.05.2011 - 15.08.2011
6.1. Выявление общих
закономерностей коэволюции
генома и фенома на модели
синтропии сердечно-сосудистого
континуума;
6.2. Разработка научно-
методических материалов и
программы внедрения результатов
НИР в образовательный процесс;
6.3. Патентные исследования
6.4.Статистический анализ данных,
позволяющий рассчитать и
проанализировать структуру
гаплотипов исследуемых генов, а
также многомерный статистический
анализ взаимосвязи гаплотипов и
сочетаний генотипов в разных
локусах с различными фенотипами.
Развернуть

Программа

Программа "Научные и научно-педагогические кадры инновационной России" на 2009 - 2013 годы

Программное мероприятие

1.1 Проведение научных исследований коллективами научно-образовательных центров
Продолжительность работ
2012 - 2013, 13 мес.
Бюджетные средства
1,96 млн
Организация
ИБР РАН
профинансировано
Продолжительность работ
2010 - 2012, 30 мес.
Бюджетные средства
3 млн
Организация
Томский НИМЦ
профинансировано
Тема
Редактирование генома сельскохозяйственных растений для улучшения хозяйственных признаков
Продолжительность работ
2017 - 2019, 26 мес.
Бюджетные средства
46 млн
Количество заявок
0
Тема
Исследование генетического разнообразия возбудителей биогельминтозов человека, передающихся через рыбу, ракообразных и продукты их переработки.
Продолжительность работ
2009 - 2010, 17 мес.
Бюджетные средства
7 млн
Количество заявок
2
Тема
Разработка систем молекулярной идентификации и оценка вариабельности геномов отечественных сортов важнейших овощных культур.
Продолжительность работ
2008 - 2009, 17 мес.
Бюджетные средства
7,8 млн
Количество заявок
2
Тема
Разработка метода определения фенотипических характеристик человека, включая пол, группу крови, варианты цвета глаз и волос, по образцу ДНК.
Продолжительность работ
2008 - 2009, 17 мес.
Бюджетные средства
7,8 млн
Количество заявок
2
Тема
Разработка методов сохранения разнообразия эксплуатируемых популяций проходных видов лососевых рыб в северных и дальневосточных регионах России.
Продолжительность работ
2008 - 2009, 14 мес.
Бюджетные средства
10 млн
Количество заявок
1