Регистрация / Вход
Прислать материал

Экспериментально-теоретические исследования структуры и самоорганизации сложных биомакромолекулярных комплексов

Стадии проекта
Предложение принято
Конкурс завершен
Проект закончен
Проект
02.740.11.0295
Организация
ИБ РАН
Руководитель работ
Овчинников Лев Павлович
Продолжительность работ
2009 - 2011, 25 мес.
Бюджетные средства
15 млн
Внебюджетные средства
3 млн

Информация отсутствует

Этапы проекта

1
07.07.2009 - 20.10.2009
В течение первого этапа работы по Госконтракту (09 июля - 20 октября 2009 г) согласно Календарному плану проведены предварительные исследования и получены следующие результаты:
I – Собраны дифракционные данные высокого разрешения с нативных и селено-метиониновых кристаллов N-концевого фрагмента архейного рибосомного белка L10.
II – Найдены условия кристаллизации мутантных форм белка Hfq.
III – Проведены предварительные структурные исследования полученных кристаллов белка РаеHfq H57T.
IV - Проведен поиск условий эффективной самоорганизации для молекулярных шаперонов GroEL, GroES и α-кристаллина.
V- Определены условия формирования амилоидных структур апомиоглобином (и его мутантными формами) и искусственным белком - альбебетином (и его мутантными формами) in vitro.
VI- Установлено, что патогенные амилоидные структуры могут образовываться в условиях близких к физиологическим, если структура белков дестабилизирована мутациями.
Таким образом, все запланированные на 1-ый этап предварительные исследования выполнены в срок, что позволяет перейти к выполнению задач 2-ого этапа: «Структурные исследования и разработка алгоритмов предсказания».
Развернуть
2
21.10.2009 - 15.12.2009
2.1. Определение структуры
N-концевого фрагмента белка L10 и сбор
дифракционных данных с
полученных кристаллов
белка Нfq
2.2. Разработка алгоритмов
предсказания
амилоидогенных участков в
полипептидных цепях
2.3. Разработка баз данных
для установления
взаимосвязи
аминокислотных
последовательностей
белков с их
пространственной
организацией
2.4. Исследование процесса
самоорганизации
гептамерного ко-шаперона
GroES
Развернуть
3
01.01.2010 - 15.08.2010
3.1. Уточнение модели
архейной рибосомы с
помощью определенной
структуры N-концевого
фрагмента белка L10 и построение структурных
моделей мутантных
форм белка Нfq 3.2. Выяснение
принципов
внутримолекулярной
упаковки больших
структурных блоков в
сложных глобулярных
белках и развитие теории
предсказания ядер
сворачивания в сложных
белках (многодоменных,
олигомерных, с
дисульфидными
связями)
3.3. Развитие и
усовершенствование
алгоритмов для
установления
взаимосвязи
аминокислотных
последовательностей
белков с их
пространственной
организацией 3.4. Стереохимический
анализ определенных
пространственных
структур мутантных
форм белка Нfq
Развернуть
4
01.09.2010 - 15.12.2010
4.1. Оптимизация
условий роста
кристаллов рибосомного
белка Ы2, и в случае
получения пригодных к
рентгеноструктурному
анализу кристаллов, сбор
дифракционных данных
и построение карт
электронной плотности
4.2. Кинетические
исследования
формирования
олигомерной структуры
молекулярного шаперона
GroEL и а-кристаллина 4.3. Кинетические
исследования
формирования
амилоидных структур
апомиоглобином и
альбебетином
Развернуть
5
01.01.2011 - 15.06.2011
5.1. Уточнение
стехиометрии белков L10
и L12 в составе их комплекса и построение
модели этого комплекса
в составе рибосомы
5.2. Разработка моделей
самоорганизации
олигомерных шаперонов
GroEL, GroES и а-
кристаллина
5.3. Создание модели и
описание механизмов
образования активной
гексамерной формы
белка Нfq и вовлечения гексамеров в
образование
фибриллярных форм
Развернуть
6
16.06.2011 - 30.08.2011
6.1 .Разработка модели
формирования
амилоидных структур
белками 6.2. Создание базы
данных по первичным и
пространственным
структурам
амилоидогенных белков
6.3. Разработка
программы внедрения
результатов НИР в
образовательный
процесс
6.4. Проведение
патентных исследований
6.5. Обобщение
результатов НИР,
подготовка публикаций и
составление итогового
отчета по
государственному
контракту в целом.
Развернуть

Программа

Программа "Научные и научно-педагогические кадры инновационной России" на 2009 - 2013 годы

Программное мероприятие

1.1 Проведение научных исследований коллективами научно-образовательных центров
Продолжительность работ
2008, 3 мес.
Бюджетные средства
1,2 млн
Организация
ИФХЭ РАН
профинансировано
Тема
Экспериментальные и теоретические исследования самоорганизации сложных белковых структур.
Продолжительность работ
2008, 3 мес.
Бюджетные средства
1,2 млн
Количество заявок
2
Тема
Исследование методов самоорганизации многофункциональных наночастиц и молекулярных кластеров для структур наноэлектроники
Продолжительность работ
2005 - 2006, 23 мес.
Бюджетные средства
4 млн
Количество заявок
2
Тема
Разработка и реализация технологий решения вычислительно-сложных задач на базе распределенных неоднородных вычислительных ресурсов.
Продолжительность работ
2005 - 2006, 23 мес.
Бюджетные средства
6,3 млн
Количество заявок
12
Тема
Экспериментально-теоретические исследования эрозионных процессов в условиях стохастического инициирования и схлопывания кавитационных каверн в вихревом турбулентном потоке.
Продолжительность работ
2008 - 2009, 14 мес.
Бюджетные средства
12 млн
Количество заявок
2
Тема
Организационно-техническое обеспечение проведения всероссийской конференции с элементами научной школы для молодежи "Баксанская молодежная школа экспериментальной и теоретической физики"
Продолжительность работ
2009, 4 мес.
Бюджетные средства
0,7 млн
Количество заявок
1