Регистрация / Вход
Прислать материал

Исследование микроэкологии бактериофагов в составе микрофлоры тела человека и животных как базис для рациональной фаговой терапии

Стадии проекта
Предложение принято
Конкурс завершен
Проект закончен
Проект
02.740.11.0313
Руководитель работ
Гальченко Валерий Федорович
Продолжительность работ
2009 - 2011, 26 мес.
Бюджетные средства
12,2 млн
Внебюджетные средства
3,05 млн

Информация отсутствует

Этапы проекта

1
07.07.2009 - 30.10.2009
-Анализ научно-технической литературы.
-Проведение работ по совершенствованию системы IS1-фингерпринтинга энтеробактерий и апробация системы на изолятах из не менее чем 3 видов млекопитающих, включая не менее 1 вида лабораторных животных, и человека.
-Определение и аннотация полной геномной последовательности одного из изолятов природных колифагов -потенциального модельного фага, взаимодействующего с клетками-персистерами.
-Разработка метода типирования изолятов вагинальных лактобацилл человека с применением MALDI-TOF спектроскопии, и анализ внутривидового разнообразия лактобацилл у пациентов с нормоценозом влагалища.
- Закладка коллекции первичных культур лактобацилл (не менее 25 охарактеризованных штаммов), пополняемой на последующих этапах работ
Развернуть
2
01.11.2009 - 10.12.2009
- Проведение
работ по исследованию
особенностей
жизненного цикла и
исследование протеома
модельного
бактериофага,
секвенированного на
этапе 1.
- Подготовка
научно-методических
материалов для
обзорно-аналитической
статьи, суммирующей
результаты анализа
научной литературы по
теме исследования.
- Анализ
внутривидового
разнообразия
вагинальных
лактобацилл у
пациентов с микробным
пейзажем, характерным
для бактериального
вагиноза, методом масс-
спектрометрии.
Пополнение коллекции
данными изолятами.
Развернуть
3
01.01.2010 - 30.07.2010
- Создание набора
тест-культур
лабораторных и полевых
штаммов энтеробактерий
для использования в
экспериментах по
слежению за
изменениями во времени
спектра колифагов в
кишечном сообществе
Исследование
изменений во времени
структуры вирусного
сообщества не менее, чем
у двух видов
млекопитающих с
использованием в
качестве модели
колифагов,
определяемых на
предварительно
подобранном наборе
тест-культур
Разработка
методики
препаративного
получения клеток —
персистеров Е. coli и
подбор методов анализа
цикла развития фагов
при использовании этих Г
клеток в качестве
хозяина..
Подготовка
эксперимента по
определению
чувствительности
резидентных популяций
энтеробактерий
лабораторных животных
к экзогенно вносимым
фагам.
- Подготовка научно-
методических
материалов для
рукописи статьи,
посвящённой анализу
генома фага,
исследованного на
предыдущих этапах - Первый этап
эксперимента по
мониторингу динамики
внутривидового
разнообразия
вагинальных
лактобацилл у людей.
- Дальнейшее
пополнение коллекции
вагинальных изолятов
лактобацилл.
Первый этап
скрининга созданных
коллекции вагинальных
изолятов лактобацилл
для обнаружения
лизогенных штаммов
Развернуть
4
01.08.2010 - 10.12.2010
Проведение
эксперимента по
определению
чувствительности
резидентных популяций
энтеробактерий
лабораторных животных
к экзогенно вносимым
фагам. Исследование
взаимодействия фагов с
клетками - персистерами
на основе методик,
разработанных на
предыдущем этапе.
Подготовка
научно-методических
материалов для научной
статьи по завершённым к
данному этапу
исследованиям
- Выбор не менее двух
изолятов природных
фагов, представляющих
интерес с точки зрения
анализа механизмов
взаимодействия с
бактериями,
колонизирующими с
защищённые
экологические ниши.
Первичная
характеристика этих
фагов и подготовка к
определению их полной
геномной
последовательности - Второй этап эксперимента
по мониторингу динамики
внутривидового
разнообразия лактобацилл,
начатого на предыдущем
этапе.
-Заключительный этап
формирования коллекции
вагинальных изолятов
лактобацилл.
- Второй этап скрининга
коллекции изолятов
лактобацилл с целью
обнаружения лизогенных
штаммов
Развернуть
5
01.01.2011 - 30.06.2011
Проведение
исследования
фармакодинамики
модельных препаратов
бактериофагов на
лабораторных
животных, в том числе
сравнительное
исследование
эффективности
транслокации из
кишечника в кровь не
менее, чем 3 фагов
различных типов.
Исследование явления
физиологической
виремии у людей и
животных.
- Определение и
аннотация полных
последовательностей
геномов фагов,
отобранных на
предыдущем этапе.
-Подготовка
научно-методических
материалов для курса
лекций «Биология
вирусов прокариот>ь и
комплекта
методических и
демонстрационных
материалов к данному
курсу лекций Заключительный этап
скрининга коллекции
лактобацилл с целью
обнаружения
лизогенных штаммов,
начатого на
предыдущем этапе.
-Анализ
полученных
результатов
исследования динамики
и разнообразия
вагинальных
лактобацилл и
разработка на их основе
критериев выбора
штаммов,
перспективных для
создания на их основе
вагинальных
пробиотических
препаратов. Отбор из
имеющейся коллекции
изолятов штаммов,
соответствующих этим
критериям и их
характеристика. Анализ
полученных
результатов с точки
зрения верификации
гипотезы об участии
фаговой инфекции
лактобацилл в
патогенезе
бактериального
вагиноза.
Развернуть
6
01.07.2011 - 15.09.2011
Постановка
экспериментов по
селекции фагов,
обладающих
повышенной
способностью к
транслокации.
Анализ
протеомов и
особенностей
жизненного цикла и
морфологии фагов,
геномы которых
определены на
предыдущем этапе.
- Разработка программы
внедрения результатов
НИР в образовательный
процесс.
Развернуть

Программа

Программа "Научные и научно-педагогические кадры инновационной России" на 2009 - 2013 годы

Программное мероприятие

1.1 Проведение научных исследований коллективами научно-образовательных центров
Тема
Разработка технологии получения комплексных синбиотиков для восстановления микрофлоры и поддержки иммунной системы организма человека.
Продолжительность работ
2005 - 2006, 23 мес.
Бюджетные средства
12 млн
Количество заявок
0
Тема
Системы иммунодетекции особо опасных инфекций, в том числе с использованием технологии фагового дисплея.
Продолжительность работ
2005 - 2006, 23 мес.
Бюджетные средства
10 млн
Количество заявок
3
Тема
Механизмы генетической интеграции бобовых растений с полезной почвенной микрофлорой.
Продолжительность работ
2008 - 2009, 17 мес.
Бюджетные средства
7,8 млн
Количество заявок
2
Тема
Молекулярная визуализация и ЯМР метаболомика в биомедицинских исследованиях патологий человека и животных.
Продолжительность работ
2008, 3 мес.
Бюджетные средства
1,2 млн
Количество заявок
1
Тема
Разработка штамма-продуцента и методики очистки рекомбинантного плазминогена человека для тромболитической терапии.
Продолжительность работ
2008 - 2009, 17 мес.
Бюджетные средства
7,8 млн
Количество заявок
2