Регистрация / Вход
Прислать материал

Молекулярные механизмы стресс-специфического контроля экспрессии генов животных

Стадии проекта
Предложение принято
Конкурс завершен
Проект закончен
Проект
02.740.11.0705
Организация
ИЦиГ СО РАН
Руководитель работ
Дымшиц Григорий Моисеевич
Продолжительность работ
2010 - 2012, 30 мес.
Бюджетные средства
9,6 млн
Внебюджетные средства
1,92 млн

Информация отсутствует

Участники проекта

Зам. руководителя работ
Меркулова Татьяна Ивановна

Этапы проекта

1
05.04.2010 - 15.09.2010
1.1. Проведение патентных исследований.
1.2. Отработка оптимальных условий подготовки иммунопреципитированного материала (средняя длина фрагментов ДНК, количество, степень очистки) для создания библиотек, пригодных для системы массового параллельного секвенирования (SOLiD).
1.3. Получение образцов суммарной мРНК из тканей печени крыс, подвергнутых воздействию гепатоканцерогенных аминоазосоединений.
1.4. Оптимизация технологии ПЦР в реальном времени: разработка метода определения активности флэп-эндонуклеазы с использованием флуоресцентных меток.
1.5. Создание выборок нуклеотидных последовательностей мРНК генов эукариот. Проведение первичного компьютерного анализа контекстных характеристик, связанных с эффективностью инициации трансляции.
1.6. Изучение влияния ксенобиотической активации и инактивации Д2-подобных рецепторов на метаболизм дофамина в нормальных и стрессирующих условиях.
1.7. Исследование метаболизма дофамина у самок дрозофилы со сниженной экспрессией гена DD2R (полученной с помощью РНК-интерференции на трансгенных линиях).
Развернуть
2
16.10.2010 - 15.11.2010
2.1. Получение иммунопреципитированного материала органов крысы для создания библиотек системы SOLiD
2.2. Изучение изменений транскриптома печени крысы под действием гепатоканцерогенных аминоазосоединений с помощью микрочипового анализа. Анализ полученных данных и отбор потенциальных генов-мишеней опухолевых супрессоров семейства FOX и генов, продукты которых связаны с контролем пролиферации и апоптоза
2.3. Оптимизация алгоритмов количественного ОТ ПЦР-анализа для проведения высокоточных измерений
2.4. А Исследование контекстных характеристик нетранслируемых районов мРНК генов животных, связанных с эффективностью трансляции в норме и при стрессе.
2.5. Изучение влияния ксенобиотической активации Д2-подобных рецепторов на метаболизм ювенильного гормона в нормальных и стрессирующих условиях.
2.6. Исследование метаболизма ювенильного гормона самок дрозофилы, у которых экспрессия гена DDR2 специфически снижена в железе, производящей ювенильный гормон (с помощью тканеспецифичной РНК-интерференции на линиях трансгенных мух).
Развернуть
3
01.01.2011 - 31.05.2011
Определение уровня экспрессии ключевых генов ренин-ангиотензин-альдостероновой системы крысы в норме и при стрессе
Развернуть
4
01.06.2011 - 15.11.2011
4.1. Полногеномный анализ распределения сайтов связывания SF1 в различных тканях крысы в условиях in vivo, выявление общих и тканеспецифичных сайтов и генов-мишеней SF1.
4.2. Определение уровня экспрессии ключевых генов симпато-адреналовой системы крысы в норме и при стрессе
4.3. Изучение влияния гепатоканцерогенов на экспрессию генов, продукты которых связаны с контролем пролиферации, в печени экспериментальных животных
4.4. Иммуногистохимическая оценка содержания и локализации Д2-подобных рецепторов в яичниках дрозофилы – месте синтеза 20-гидроксиэкдизона.
4.5. Измерение титра 20-гидроксиэкдизона у самок дрозофилы со сниженной посредством РНК-интерференции экспрессией гена DD2R в железе, синтезирующей ювенильный гормон.
Развернуть
5
01.01.2012 - 31.05.2012
5.1. Сравнительное изучение паттернов полногеномного распределения транскрипционных факторов семейства FOX в печени экспериментальных животных в норме и под действием гепатоканцерогенных соединений.
5.2. Исследование сайтов альтернативной инициации трансляции и их в вклада кодирующий потенциал мРНК генов стрессового ответа.
5.3. Изучение онтогенетического паттерна экспрессии гена DD2R в тканях, метаболизирующих ювенильный гормон, у самок дрозофилы дикого типа и с генетической абляцией части клеток железы (corpus allatum), в которой гормон синтезируется.
Развернуть
6
01.06.2012 - 18.10.2012
6.1. Реконструкция схемы регуляторных событий, ведущих к развитию опухолей печени под действием гептоканцерогенных аминоазосоединений.
6.2. Создание комплексной математической модели регуляции почечных процессов и ее роли в развитии артериальной гипертонии
6.3. Создание базы данных мРНК генов эукариот, содержащих сигналы стресс-специфической трансляции.
6.4. Изучение онтогенетического паттерна экспрессии гена DD2R в яичниках дрозофилы - ткани, синтезирующей 20-гидроксиэкдизон.
6.5. Разработка программы внедрения результатов НИР в образовательный процесс.
6.6. Реконструкция механизмов молекулярно-генетического контроля экспрессии генов, регулирующих взаимодействие стресс-связанных гормонов круциальное для сохранения гормонального статуса организма в условиях стресса.
Развернуть

Программа

Программа "Научные и научно-педагогические кадры инновационной России" на 2009 - 2013 годы

Программное мероприятие

1.1 Проведение научных исследований коллективами научно-образовательных центров
Продолжительность работ
2010 - 2012, 24 мес.
Бюджетные средства
6,25 млн
Организация
ФИЦ КазНЦ РАН
профинансировано
Продолжительность работ
2012 - 2013, 16 мес.
Бюджетные средства
5,25 млн
Организация
ИМБ РАН
профинансировано
Продолжительность работ
2010 - 2012, 30 мес.
Бюджетные средства
3,6 млн
Организация
ИЦиГ СО РАН
профинансировано
Тема
Идентификация и высокоразрешающее картирование генов и их экспрессии на ранних этапах онтогенеза животных на установке: "Комплексная установка для анализа ультраструктуры и молекулярного состава биологических объектов (КОМУС-1) (рег. № 06-03)"
Продолжительность работ
2005 - 2006, 23 мес.
Бюджетные средства
0,7 млн
Количество заявок
1
Тема
Создание композиции молекулярных адъювантов на основе лигандов к TOLL и NOD – рецепторам.
Продолжительность работ
2011 - 2012, 15 мес.
Бюджетные средства
12 млн
Количество заявок
1
Тема
Молекулярная визуализация и ЯМР метаболомика в биомедицинских исследованиях патологий человека и животных.
Продолжительность работ
2008, 3 мес.
Бюджетные средства
1,2 млн
Количество заявок
1
Тема
Разработка высокочувствительных биолюминесцентных тестеров нового поколения для экспресс-контроля микробных загрязнений в медицине, сельском хозяйстве и различных отраслях промышленности.
Продолжительность работ
2005 - 2006, 23 мес.
Бюджетные средства
8 млн
Количество заявок
2
Тема
Изучение молекулярного контроля биосинтеза цефалоспорина С в мицелиальном грибе Aсremonium сhrysogenum.
Продолжительность работ
2008 - 2009, 17 мес.
Бюджетные средства
7,8 млн
Количество заявок
2