Регистрация / Вход
Прислать материал

Получение нуклеиновых кислот с помощью трифосфатов дезоксинуклеозидов, содержащих низкомолекулярные функциональные группы на пиримидиновых основаниях.

Стадии проекта
Предложение принято
Конкурс завершен
Проект закончен
Проект
14.604.21.0111
Организация
ИМБ РАН
Руководитель работ
Чудинов Александр Васильевич
Продолжительность работ
2014 - 2016, 28 мес.
Бюджетные средства
14,7 млн
Внебюджетные средства
3,75 млн

Разработать методы получения фрагментов модифицированных ДНК, способных нарабатываться в ходе полимеразной цепной реакции и специфично взаимодействовать с молекулярными мишенями нуклеиновой и белковой природы

Этапы проекта

1
07.08.2014 - 31.12.2014
Выполнен аналитический обзор современной научно-технической, нормативной, методической литературы по методам получения модифицированных нуклеиновых кислот с помощью трифосфатов дезоксинуклеозидов, содержащих функциональные группы на гетероциклических основаниях 60 источников за период 2009 – 2013 гг. Проведены патентные исследования по ГОСТ 15.011-96. Выбраны структуры дезоксинуклеозидтрифосфатов с функциональными группами на гетероциклических основаниях для получения модифицированных ДНК в ходе ПЦР. Выбраны схемы и методов синтеза выбранных структур трифосфатов дезоксинуклеозидов с функциональными группами на гетероциклических основаниях. За счет внебюджетных средств проведен подбор условий для хроматографической очистки и масс-спектрометрического контроля полупродуктов и 2 (двух) экспериментальных образцов трифосфатов дезоксинуклеозидов с функциональными группами на гетероциклических основаниях и полупродуктов, использовавшихся при их синтезе; проведена подготовка к лабораторным испытаниям 2 (двух) экспериментальных образцов трифосфатов дезоксинуклеозидов с низкомолекулярными функциональными группами на гетероциклических основаниях в качестве реагентов ПЦР; проведен подбор условий для химической очистки растворителей и исходных реагентов, используемых при синтезе 2 (двух) трифосфатов дезоксинуклеозидов с функциональными группами на гетероциклических основаниях.
Развернуть
2
01.01.2015 - 30.06.2015
Синтез не менее 3 (трех) экспериментальных образцов трифосфатов дезоксинуклеозидов с функциональными группами на гетероциклических основаниях различающихся химическим строением функциональной группы и химическим строением линкера, связывающего функциональную группу с гетероциклическим основанием.
  Экспериментальная оценка степени включения нуклеозидтрифосфатов с функциональными группами в ДНК, в том числе методом достраивания праймера (primer extension).
Развернуть
3
01.07.2015 - 31.12.2015
Выполнен экспериментальный подбор условий для проведения ПЦР с трифосфатами дезоксинуклеозидов для получения модифицированных ДНК. Проведена экспериментальная проверка афинных (специфичных) свойств полученных в ходе ПЦР фрагментов ДНК с функциональными группами на гетероциклических основаниях в отношении молекулярных мешеней, на основе ДНК. Синтезировано 6 (шесть) экспериментальных образца трифосфатов дезоксинуклеозидов. Проведена экспериментальная оценка степени включения нуклеозидтрифосфатов методом достраивания праймера (primer extension). Выполнена хроматографическая очистка и масс-спектрометрический контроль 6 (шести) промежуточных полупродуктов и образцов трифосфатов дезоксинуклеозидов. Проведены лабораторные испытания 6 (шести) экспериментальных образцов трифосфатов дезоксинуклеозидов с низкомолекулярными функциональными группами на гетероциклических основаниях в качестве реагентов ПЦР. Выполнена химическая очитска растворителей и исходных реагентов для синтеза 6 (шести) трифосфатов дезоксинуклеозидов с функциональными группами на гетероциклических основаниях.
Развернуть
4
01.01.2016 - 30.06.2016
Синтезировано 7 дезоксинуклеозидтрифосфатов с функциональными группами на гетероциклических основаниях различающихся химическим строением функциональной группы и линкера. Синтезированы библиотеки олигонуклеотидов, изготовлена матрица олигонуклеотидных зондов для контроля афинных свойств ДНК с функциональными группами на нуклеиновых основаниях. Проведена комплексная экспериментальная оценка степени включения нуклеотидов с функциональными группами в ДНК, в том числе на матрицах олигонуклеотидных зондов и методом секвенирования, выбран наиболее эффективный трифосфат дезоксинуклеозида. Оптимизирована методика получения наиболее эффективного трифосфата дезоксинуклеозида.
Развернуть
5
01.07.2016 - 31.12.2016
Синтезировано 7 дезоксинуклеозидтрифосфатов различающихся химическим строением функциональной группы и линкера. Синтезированы библиотеки олигонуклеотидов, изготовлена матрица олигонуклеотидных зондов для контроля афинных свойств ДНК. Изготовлена экспериментальная партия наиболее эффективного дезоксинуклеозидтрифосфата. Разработаны рекомендации по возможности использования результатов проведенных ПНИ в реальном секторе экономики.
Развернуть

Программа

Программа "Исследования и разработки по приоритетным направлениям развития научно-технологического комплекса России на 2014-2020 годы"

Программное мероприятие

1.2 Проведение прикладных научных исследований для развития отраслей экономики
Тема
Создание амплифицируемых аффинных реагентов на основе ДНК с модифицированными основаниями
Продолжительность работ
2014 - 2016, 29 мес.
Бюджетные средства
30 млн
Количество заявок
4
Тема
Направленный поиск противовирусных соединений избирательного действия на основе модифицированных гетероциклических оснований нуклеиновых кислот и нуклеозидов.
Продолжительность работ
2008 - 2009, 17 мес.
Бюджетные средства
7,8 млн
Количество заявок
2
Тема
Разработка противовирусных нанокомпозитов диоксида титана с каталитически активными нуклеиновыми кислотами.
Продолжительность работ
2009 - 2010, 17 мес.
Бюджетные средства
7 млн
Количество заявок
1
Тема
Разработка метода направленной доставки терапевтических нуклеиновых кислот в ткани-мишени на основе суперпарамагнитных частиц.
Продолжительность работ
2008 - 2009, 17 мес.
Бюджетные средства
7,8 млн
Количество заявок
1
Тема
Разработка конструкций на основе нуклеиновых кислот, индуцирующих при введении в организм синтез белков, подавляющих опухолевый рост.
Продолжительность работ
2011 - 2012, 21 мес.
Бюджетные средства
36 млн
Количество заявок
8