Регистрация / Вход
Прислать материал

Системно-функциональный анализ альтернативного сплайсинга

Стадии проекта
Предложение принято
Конкурс завершен
Проект закончен
Проект
14.740.11.0003
Организация
ИППИ РАН
Руководитель работ
Кулешов Александр Петрович

Выполнение НИР должно обеспечивать достижение научных результатов мирового уровня, подготовку и закрепление в сфере науки и образования научных и научно-педагогических кадров, формирование эффективных и жизнеспособных научных коллективов, развитие международного сотрудничества в научно-технической сфере

Участники проекта

Зам. руководителя работ
Гельфанд Михаил Сергеевич

Этапы проекта

1
27.07.2010 - 30.09.2010
1.1. Разработка методов картирования секвенированных фрагментов на геном.
1.2. Разработка методов фильтрации неправильно или неоднозначно картированных фрагментов.
1.3. Разработка методов нормализации покрытия.
Развернуть
2
01.10.2010 - 30.11.2010
2.1 Разработка методов определения частоты альтернативно сплайсируемых вариантов на основе анализа эккзон-экзонных границ и покрытия альтернативных сегментов.
2.2 Идентификация новых вариантов альтернативного сплайсинга.
2.3 Проведение патентных исследований.
2.4 Оценка стабильности наблюдаемых частот включения в технических и биологических репликах.
2.5 Оценка устойчивости данных о покрытии в технических и биологических репликах.
Развернуть
3
01.01.2011 - 30.06.2011
3.1 Сопоставление частот вариантов альтернативного сплайсинга в зависимости от ткани и возраста.
3.2 Выделение альтернативных сегментов и генов со статистически различиями во включении.
3.3 Сопоставление результатов, получаемых при использовании экзон-экзонных границ и покрытия сегментов.
3.4 Изучение альтернативного сплайсинга генов серотонэргической системы в коре и мозжечке и его возрастных изменений.
Развернуть
4
01.07.2011 - 30.11.2011
4.1 Исследование влияния на альтернативный сплайсинг изменения уровня экспрессии факторов сплайсинга (нокаут и гиперэкспрессия).
4.2 Поиск генов, регулируемых факторами сплайсинга из семейства L-подобных белков.
4.3 Исследование тканевой и возрастной специфичности экспрессии некодирующих РНК.
4.4 Исследование химерных транскриптов в сопоставлении с данными о пространственной структуре хроматина в клетке.
Развернуть
5
01.01.2012 - 30.06.2012
5.1 Классификация альтернативно сплайсируемых сегментов и генов в зависимости от тканевой и возрастной специфичности.
5.2 Оценка функциональных особенностей генов в получаемых классах.
5.3 Поиск потенциальных регуляторов возраст-зависимого альтернативного сплайсинга.
5.4 Разработка программы внедрения результатов НИР в образовательный процесс.
5.5 Исследование возрастных особенностей альтернативного сплайсинга и уровней экспрессии дуплицированных генов.
Развернуть
6
01.07.2012 - 15.12.2012
6.1 Сопоставление данных о включении альтернативных сегментов в зрелые мРНК у эволюционно близких организмов.
6.2 Обобщение результатов, полученных на предыдущих этапах.
6.3 Регистрация интеллектуальной собственности.
6.4 Подготовка итогового отчета.
6.5 Сопоставление полученных данных об эволюции альтернативного сплайсинга и о частотах нуклеотидных замен в соответствующих генах.
Развернуть

Программа

Программа "Научные и научно-педагогические кадры инновационной России" на 2009 - 2013 годы

Программное мероприятие

1.1 Проведение научных исследований коллективами научно-образовательных центров
Продолжительность работ
2010 - 2012, 27 мес.
Бюджетные средства
9,9 млн
Организация
ИМБ РАН
профинансировано
Продолжительность работ
2010 - 2012, 30 мес.
Бюджетные средства
10,5 млн
Организация
ИСАН
профинансировано
Тема
«Проведение научных исследований коллективами научно-образовательных центров, принимающих участие в 7-й Рамочной Программе Евросоюза в области технических и естественных наук»
Продолжительность работ
2010 - 2012, 30 мес.
Бюджетные средства
15 млн
Количество заявок
67
Тема
«Проведение научных исследований коллективами научно-образовательных центров в области cистемной биологии, биоинформатики и промышленной биотехнологии совместно с научными организациями Германии».
Продолжительность работ
2010 - 2012, 29 мес.
Бюджетные средства
15 млн
Количество заявок
30
Тема
Проведение научных исследований коллективами научно-образовательных центров совместно с малыми инновационными предприятиями в области энергосбережения
Продолжительность работ
2010 - 2012, 28 мес.
Бюджетные средства
15 млн
Количество заявок
72
Тема
Проведение научных исследований коллективами научно-образовательных центров совместно с малыми инновационными предприятиями в области информационно-телекоммуникационных технологий
Продолжительность работ
2010 - 2012, 28 мес.
Бюджетные средства
15 млн
Количество заявок
65
Тема
Проведение научных исследований коллективами научно-образовательных центров совместно с малыми инновационными предприятиями в области высокотехнологичной медицинской техники
Продолжительность работ
2010 - 2012, 28 мес.
Бюджетные средства
15 млн
Количество заявок
52