Регистрация / Вход
Прислать материал

Разработка программных средств для анализа способов реализации генетической информации на различных уровнях строения биосистем в процессах их функционирования.

Стадии проекта
Предложение принято
Конкурс завершен
Выполнение этапа проекта
Проект
02.434.11.1008
Организация
ИМБ РАН

разработка новых вычислительных технологий, основывающихся на теоретических подходах и алгоритмах для исследования способов реализации генетической информации на различных уровнях строения биосистем, и применение разработанных программ для анализа механизмов проявления генетической информации при патологиях.

Этапы проекта

1
22.06.2005 - 31.08.2005
1.1 Анализ научно-технической литературы, нормативно-технической документации и других материалов, относящихся к разрабатываемой теме.
1.2 Исследование принципов построения интегрированной системы анализа генетической информации.
1.3 Предварительная разработка структуры входных и выходных данных. Разработка общего описания алгоритмов программного комплекса, соответствующих пунктам 1), 2), 3), 4), 5), 6), 7), 8), 9), 10), 11), 12) раздела 4.3. Технического задания.
Участие соисполнителей ПГУ и ВГУ в разработке алгоритмов по пунктам 3), 5) и 6) ТЗ соответственно.
1.4 Проведение патентных исследований по ГОСТ 15.011-96 программных компонентов, не имеющих зарубежных аналогов (соответствующих пунктам 6), 9), 10), 11) раздела 4.3. ТЗ).
1.5 Составление промежуточного отчета.
Развернуть
2
01.09.2005 - 08.12.2005
Проведен анализ научно-технической литературы, нормативно-технической документации и других материалов, относящихся к разрабатываемой теме. Исследованы принципы построения интегрированной системы анализа генетической информации. Закончена предварительная разработка структуры входных и выходных данных. Разработана структура алгоритмов программного комплекса, а также системы их взаимодействия в рамках единой системы. Проведены патентные исследования по ГОСТ 15.011-96.
Развернуть
3
01.01.2006 - 30.06.2006
Результаты работы на отчётном третьем промежуточном этапе:
- разработана программная документация для каждого компонента,
- составлены программы и методики тестовых испытаний,
- описаны результаты тестовых испытаний для каждого компонента,
- проведены проблемно-ориентированные исследования в заданных направлениях.
Развернуть
4
01.07.2006 - 31.10.2006
- определены картины периодичностей в генетических текстах с выделением вырожденных тандемных повторов;
  - сегментирован на однородные блоки геном человека;
  - выделены характерные участки, содержащие кластеры сайтов связывания специфичных к ДНК факторов;
  - уточнена аннотация 10 вновь секвенированных геномов;
  - определена степень полиморфизма двойной спирали ДНК как сложной функции структуры от последовательности оснований;
  - проведён расчет структуры представляющих наибольший биологический интерес РНК;
  - прогнозированы с вероятностью 0,8, не менее, вторичные структуры белков, включая структуру типа полипролин II;
  - создана база данных структурных доменов и линкеров белков;
  - определены физико-химические факторы, вносящие вклад в формирование пространственной структуры белковой молекулы;
  - осуществлён анализ вклада отдельных генов и отдельных аллелей внутри гена в конкретные мультигенные заболевания;
  - создана база данных, на основе выявляются характерные особенности различных классов мутаций (патогенные, онкогенные, функционально нейтральные) в белках человека и других видов;
  - проведена корректировка и доработка программных компонентов и программной документации, обобщены результаты предыдущих этапов работ.
Развернуть

Программа

Программа "Исследования и разработки по приоритетным направлениям развития науки и техники" на 2002-2006 годы

Программное мероприятие

1.2 Проблемно-ориентированные поисковые исследования фундаментального характера
Продолжительность работ
2007 - 2008, 17 мес.
Бюджетные средства
6 млн
Организация
ВСГУТУ
профинансировано
Продолжительность работ
2014 - 2018, 48 мес.
Бюджетные средства
25 млн
профинансировано
Продолжительность работ
2010 - 2012, 29 мес.
Бюджетные средства
7,5 млн
Организация
ИЦиГ СО РАН
профинансировано
Тема
Разработка программных средств для анализа способов реализации генетической информации на различных уровнях строения биосистем в процессах их функционирования.
Продолжительность работ
2005 - 2006, 23 мес.
Бюджетные средства
6 млн
Количество заявок
2
Тема
Создание программного комплекса информационно-аналитической поддержки научно-технической деятельности на основе вычислительного семантического поиска и анализа неструктурированной текстовой информации.
Продолжительность работ
2011 - 2013, 28 мес.
Бюджетные средства
120 млн
Количество заявок
16
Тема
Разработка алгоритмов и программных систем для решения задач анализа последовательностей, возникающих в теоретической и прикладной геномике
Продолжительность работ
2011 - 2012, 16 мес.
Бюджетные средства
50 млн
Количество заявок
13
Тема
Разработка программных средств смыслового поиска и анализа материалов научных исследований в области наук о жизни, опубликованных на естественных языках в научной печати и в Интернете.
Продолжительность работ
2005 - 2006, 23 мес.
Бюджетные средства
10 млн
Количество заявок
4
Тема
Выполнение опытно-конструкторских работ по теме: «Разработка программного информационного комплекса многоаспектного анализа технически сложных объектов (ПИК «Виртуальный ТСО»)».
Продолжительность работ
2011 - 2012, 15 мес.
Бюджетные средства
97,9 млн
Количество заявок
1