Выполнение сравнительного гаплотипического анализа популяций человека из северо-западной части России, Эстонии и Западной Европы (СЕРН) во время проведения стажировки в Институте молекулярной и клеточной биологии Тартуского Университета.

В рамках научно-исследовательской работы были осуществлены следующие мероприятия: проанализировано современное состояние научных исследований в области молекулярного гаплотипирования, изучены основы методологии и стратегии генотипирования SNPs, применяемые в различных современных технологиях, освоена технология APEX генотипирования, с использованием которой были исследованы особенности распределения аллелей 48 однонуклеотидных полиморфных замен в русских популяциях Архангельской и Смоленской областей.
Анализ гаплотипического разнообразия генома человека – одно из бурно развивающихся направлений последнего времени, обусловленного успехом международного проекта «Геном человека» и связанной с ним идентификации огромного количества однонуклеотидных полиморфных замен. SNPs чрезвычайно обильны в геноме человека и, в отличие от других полиморфных маркеров, не характеризуются какими-либо выраженными особенностями локализации, присутствуя практически повсеместно на всем протяжении хромосом. Однонуклеотдные аллели SNPs отличаются и более высокой стабильностью. Данные характеристики SNPs в немалой степени способствовали развитию концепции паттернов неравновесия по сцеплению и связанной с ней представлениями о блочной структуре генома человека. Интенсификации исследований гаплотипического разнообразия во многом способствовала и простая структура SNPs, выражающаяся в замене оснований и позволяющая подвергать их быстрому и эффективному типированию с использованием современной технологии «микрочипов». С использованием APEX технологии генотипирования были определены аллели 48 полиморфных локусов 19 генов, вовлеченных, главным образом, в пути дофаминэргической и серотонинэргической передачи нервного импульса в двух выборках русского населения Архангельской и Смоленской областей (по 100 человек в каждой). Было выявлено 6 полиморфных локусов, частоты распределения которых в популяции русских Архангельской области достоверно отличались от таковых популяции Смоленской области. При этом два из них относились к одному и тому же гену: гену пропиомеланокортина Выявленные различия в распределении аллелей могут рассматриваться как следствие каких-либо воздействий на параметры функционирования неровной системы. Следующим этапом нашего исследования будет расчет частот потенциально возможных гаплотипов и оценка вероятности их существования в каждой из выборок. Сравнительный анализ гаплотипического разнообразия способен выявить межпопуляционные различия, не идентифицируемые на уровне отдельных SNPs.
Полученные результаты позволят повысить уровень проводимых популяционно-генетических исследований и будут использованы с целью интенсификации изучения генетических параметров российских популяций человека, что, в свою очередь, будет способствовать идентификации и характеристике генов предрасположенности к наиболее распространенным заболеваниям.