Регистрация / Вход
Прислать материал

"Регуляция экспрессии генов: кристаллографические исследования регуляторных белков и их комплексов с РНК-мишенями".

Стадии проекта
Предложение принято
Конкурс завершен
Выполнение этапа проекта
Проект
02.445.11.7124
Организация
ИБ РАН

«Развитие системы ведущих научных школ как среды генерации знаний и подготовки научно-педагогических кадров высшей квалификации»

Этапы проекта

1
05.09.2005 - 04.11.2005
В результате проведенных исследований: завершен анализ РНК-белковых взаимодействий в регуляторном комплексе архейного рибосомного белка L1 с фрагментами его мРНК; получены кристаллы и определена пространственная структура комплекса бактериального рибосомного белка L1 с фрагментом мРНК; проведен сравнительный анализ структур архейного и бактериального регуляторных комплексов, а также рибосомного комплекса белка L1, что позволило выделить инвариантную структуру в РНК, узнаваемую белком L1, и идентифицировать аминокислотные остатки в белке, играющие ключевую роль во взаимодействии с РНК; проанализированы РНК-белковые взаимодействия, что позволило получить мутантные формы белка L1 с измененным сродством к РНК. Анализ полученных данных позволяет сделать вывод, что помимо комплементарности контактирующих поверхностей, важнейшую роль в РНК-белковом узнавании играют межмолекулярные водородные связи, закрытые в составе комплекса от контактов с растворителем. Важным результатом работы является определение впервые пространственной структуры бактериального рибосомного белка L1 в связанном с РНК состоянии, которая существенно отличается от структуры данного белка в изолированном состоянии. Определение истинной конформации бактериального белка L1 в комплексе с РНК создало базу для уточнения пространственной структуры бактериальной рибосомы. Методом компьютерного моделирования нами была построена модель структуры L1-домена большой субчастицы бактериальной рибосомы. Встраивание этой модели в структуру рибосомы E. coli позволило идентифицировать некоторые дополнительные взаимодействия белка L1 с 23S рРНК, что уточняет структуру функционально важного участка рибосомы. Кроме структурных исследований комплексов рибосомного белка L1 с РНК в рамках НИР были получены кристаллы α и γ субъединиц архейного фактора инициации трансляции aIF2 S. solfataricus. Собраны дифракционные данные с кристаллов aIF2γ и начато определение пространственной структуры этого белка.
Развернуть

Программа

Программа "Исследования и разработки по приоритетным направлениям развития науки и техники" на 2002-2006 годы

Программное мероприятие

1.12 Развитие системы ведущих научных школ как среды генерации знаний и подготовки научно-педагогических кадров высшей квалификации
Продолжительность работ
2005, 2 мес.
Бюджетные средства
1,2 млн
Организация
ИМГ РАН
профинансировано
Продолжительность работ
2005, 2 мес.
Бюджетные средства
1,2 млн
Организация
ФИЦ ПНЦБИ РАН
профинансировано
Тема
Развитие системы ведущих научных школ как среды генерации знаний и подготовки научно-педагогических кадров высшей квалификации. Проведение научно-исследовательских работ по приоритетным направлениям Программы
Продолжительность работ
2005 - 2006, 23 мес.
Бюджетные средства
300 млн
Количество заявок
753
Тема
Разработка новых способов регуляции экспрессии генов у эукариот.
Продолжительность работ
2008 - 2009, 17 мес.
Бюджетные средства
7,8 млн
Количество заявок
1
Тема
Выполнение научно-исследовательских работ по приоритетным направлениям Программы и поисковых исследований фундаментального характера молодыми учеными и преподавателями, проходящими стажировку в крупном российском научном (научно-образовательном) центре.
Продолжительность работ
2005 - 2006, 23 мес.
Бюджетные средства
25 млн
Количество заявок
27
Тема
Научно-организационное, методическое и техническое обеспечение создания международного научно-образовательного центра в области проектирования микро- и наносистем.
Продолжительность работ
2005 - 2006, 23 мес.
Бюджетные средства
22 млн
Количество заявок
2
Тема
Совершенствование нормативного и методического обеспечения государственной политики в сфере подготовки и аттестации научных и научно-педагогических кадров в соответствии с приоритетными направлениями развития инновационной экономики.
Продолжительность работ
2011, 2 мес.
Бюджетные средства
3 млн
Количество заявок
1