Разработка РНК-маркеров для молекулярной диагностики рака в цифровом формате

Стадии проекта

Предложение принято

Конкурс завершен

Проект закончен

Проект

02.512.11.2098

Организация

ИБ РАН

Руководитель работ

Четверин Александр Борисович

Продолжительность работ

2007 - 2008, 18 мес.

Бюджетные средства

17,6 млн

Внебюджетные средства

3,7 млн

Конкурс

Работы по проведению 2-ой очереди проблемно-ориентированных поисковых исследований и созданию научно-технического задела в области живых систем по критической технологии «Технологии биоинженерии» (мероприятие 1.2 Программы)

Работы должны проводиться в рамках критической технологии «Технологии биоинженерии». Работы должны соответствовать по предполагаемому исполнению лучшим мировым стандартам. В результате выполнения каждой работы должен быть создан необходимый потенциал, обеспечивающий переход к проведению опытно-конструкторских работ с целью последующей коммерциализации. Результаты работ должны способствовать дальнейшему инновационному развитию российских технологий в данном приоритетном направлении Программы.

Соисполнители

Организация

Химический факультет МГУ

Этапы проекта

09.04.2007 - 07.12.2007

1.1. Проанализирована научно-техническая литература, нормативно-техническая документация и другие материалы, относящиеся к разрабатываемой теме.
1.2. Проведены патентные исследования по ГОСТ 15.011-96.
1.3. Составлен и обоснован список рекомендованных к испытаниям РНК-маркеров злокачественных опухолей.
1.4. Выбраны и обоснованы направления исследований и способы решения поставленных задач.
1.5. Разработана схема проведения экспериментов по тестированию выбранных РНК-маркеров.
1.6. Подготовлена материально-техническая база экспериментов по тестированию РНК-маркеров.
1.7. Клонированы и тестированы РНК-маркеры.
1.8. Осуществлен дизайн и синтез необходимых олигонуклеотидных праймеров и флуоресцентных зондов.
1.9. Персонал обучен выбранным методам исследования.
1.10 Разработана общая методики проведения исследований.
1.11 Составлен промежуточный отчета.

01.01.2008 - 30.06.2008

Выбор, освоение и оптимизация методов первичной обработки образ-цов крови.
  Уточнение списка рекомендованных РНК-маркеров по резуль-татам модельных экспериментов. Разработка детальной методики тестирова-ния выбранных РНК-маркеров.
  Разработка нерадиоактивных способов на-блюдения растущих колоний ДНК в реальном времени.
  Разработка техноло-гичных способов выделения и очистки нуклеиновых кислот и их подготовки для анализа.
  Оптимизация способов выделения и очистки нуклеиновых ки-слот и их подготовки для анализа.

01.07.2008 - 31.10.2008

Создана полная диагностическая процедура для обнаружения оди-ночных молекул РНК заданного вида в образцах крови онкологиче-ских пациентов и в контрольных образцах.
  Разработаны контрольные тесты, доказывающих достоверность по-лученных результатов.
  Проведено тестирование выбранных РНК-маркеров с использованием клинических образцов крови онкологических пациентов и контроль-ных образцов.
  Создан список РНК-маркеров, рекомендованных для широкомас-штабных клинических испытаний.
  Создан лабораторный прототип диагностического набора, пригодный для проведения широкомасштабных клинических испытаний реко-мендованных маркеров.