Регистрация / Вход
Прислать материал

Анализ новых ингибиторов бактериальной РНК-полимеразы на основе белков бактериофагов и аптамеров и изучение транскрипционных свойств неканонических РНК-полимераз

Стадии проекта
Предложение принято
Конкурс завершен
Проект закончен
Проект
02.740.11.5132
Организация
ИМГ РАН
Руководитель работ
Минахин Леонид Станиславович

Информация отсутствует

Участники проекта

Зам. руководителя работ
Кульбачинский Андрей Владимирович

Этапы проекта

1
09.03.2010 - 01.10.2010
1.1. Выбор и обоснование принятого направления исследований.
1.2. Разработка усовершенствованного высокоэффективного метода выделения белков бактериофагов из клеток бактерий с использованием аффинной коиммунопреципитации.
1.3. Выделение белков gp39, gp76 и gp18 из термофильных бактериофагов P23-45 и YS40.
1.4. Выделение новых регуляторных белков бактериофагов P23-45, YS40, G17 и G20, связывающихся с РНК-полимеразой T. thermophilus.
1.5. Проведение отбора оцДНК-аптамеров к холоферментам РНК-полимераз E. coli, T. thermophilus и T. aquaticus.
1.6. Анализ участков связывания регуляторных белков бактериофагов с РНК-полимеразами E. coli и T. thermophilus.
1.7. Анализ участков связывания аптамеров с холоферментами РНК-полимераз E. coli, T. thermophilus и T. aquaticus.
1.8. Анализ механизма подавления активности РНК-полимеразы белками бактериофагов и аптамерами на разных стадиях транскрипции.
1.9. Создание структурной модели расположения участков связывания ингибиторов разных типов (белков бактериофагов и аптамеров) на поверхности РНК-полимеразы.
1.10. Проведение научного семинара по теме «Регуляция экспрессии генов в геномах бактериофагов в процессе инфекции».
Развернуть
2
01.01.2011 - 15.11.2011
2.1. Проведение патентных исследований по ГОСТ 15.011-96.
2.2. Анализ механизма инициации транскрипции ранних фаговых промоторов РНК-полимеразой Р23-45 in vitro и in vivo.
2.3. Изучение механизмов элонгации и терминации транскрипции РНК-полимеразы Р23-45.
2.4. Анализ механизмов нематричного синтеза РНК-полимеразы Р23-45.
2.5. Поиск дополнительных фаговых факторов, необходимых для функционирования фермента.
2.6 Создание in vitro системы для высокоэффективной транскрипции с использованием РНК-полимеразы Р23-45.
2.7. Клонирование генов гипотетических РНК-полимераз C. glutamicum и K. lactis.
2.8. Экспрессия и выделение гипотетических РНК-полимераз из штаммов E. coli и дрожжей S. cerevisiae и K. lactis.
2.9. Изучение свойств гипотетических РНК-полимераз в тестах по транскрипции in vitro.
2.10. Обобщение результатов предыдущих этапов работ.
2.11. Разработка программы внедрения результатов НИР в образовательный процесс.
2.12. Проведение научного семинара по теме «Механизмы регуляции транскрипции белками бактериофагов».
Развернуть

Программа

Программа "Научные и научно-педагогические кадры инновационной России" на 2009 - 2013 годы

Программное мероприятие

1.5 Проведение научных исследований коллективами под руководством приглашенных исследователей
Продолжительность работ
2008 - 2009, 16 мес.
Бюджетные средства
7,8 млн
Организация
ИХБФМ СО РАН
профинансировано
Процессы регуляции экспрессии генов в пластидах растений, водорослей, простейших и их эволюция 1. РНК-полимеразы фагового типа в пластидах простейших. 2. РНК-полимеразы бактериального типа в пластидах простейших, включая виды из таксономиче-ской группы Alveolata. 3. Исследование эволюции некодирующих областей пластома. 4. РНК-полимеразы бактериального типа в пластидах растений. 5. Роль взаимного расположения генов на хромосоме в ответе на тепловой стресс в пластидах ячменя. 6. РНК-полимеразы фагового типа в пластидах растений. 7. Белки, гомологичные рубредоксину, у простейших, включая виды из таксономической группы Alveolata. 8. Регуляция синтеза хлорофилла и ее роль в защите от окислительного стресса у наземных растений. 9. Регуляция синтеза хлорофилла и ее роль в защите от окислительного стресса у водорослей. 10. Влияние характера регуляции экспрессии генов на позиционную сцепленность генов в пластидах простейших. 11. Анализ рацемаз аминокислот у пробиотиков. 12. Регуляция экспрессии генов в пластидах Pi
Продолжительность работ
2011, 5 мес.
Бюджетные средства
1,8 млн
Организация
ИППИ РАН
профинансировано
Тема
Поиск селективных ингибиторов поли(ADP-рибоза)-полимеразы I человека и определение их биологических и фармакологических свойств.
Продолжительность работ
2008 - 2009, 17 мес.
Бюджетные средства
7,8 млн
Количество заявок
2
Тема
Доклинические исследования лекарственного средства на основе ингибитора вирусной РНК-полимеразы для лечения хронического гепатита С.
Продолжительность работ
2016 - 2018, 20 мес.
Бюджетные средства
33 млн
Количество заявок
2
Тема
Создание ингибиторов бактериальной системы секреции хламидий и сальмонелл, подавляющих развитие острой и хронической инфекции.
Продолжительность работ
2011 - 2012, 16 мес.
Бюджетные средства
14 млн
Количество заявок
2
Тема
Поиск, получение в бактериальных системах и структурно-функциональный анализ полипептидов направленного действия на клеточные рецепторы и ионные каналы.
Продолжительность работ
2008 - 2009, 17 мес.
Бюджетные средства
7,8 млн
Количество заявок
1
Тема
Конструирование аптамеров ДНК для предупреждения внутрисосудистого тромбообразования
Продолжительность работ
2005 - 2006, 23 мес.
Бюджетные средства
6 млн
Количество заявок
0