Реконструкция метаболизма бактерий с помощью сенсорных РНК и получение на этой основе штаммов-продуцентов
Стадии проекта
Предложение принято
Конкурс завершен
Проект закончен
Проект
02.512.11.2078
Организация
ФГУП "ГосНИИгенетика"
Руководитель работ
Миронов Александр Сергеевич
Продолжительность работ
2007, 8 мес.
Бюджетные средства
4,3 млн
Внебюджетные средства
0,86 млн
Работы должны проводиться в рамках критической технологии «Технологии биоинженерии». Работы должны соответствовать по предполагаемому исполнению лучшим мировым стандартам. Создаваемый научно-технический задел должен обеспечивать в будущем проведение опытно-конструкторских и технологических работ на конкурентном уровне. Результаты работ должны способствовать дальнейшему инновационному развитию российских технологий в данном приоритетном направлении Программы.
Соисполнители
Организация
РХТУ им. Д.И. Менделеева
Этапы проекта
1
27.02.2007 - 31.07.2007
1. Цель I этапа работы:
Изучить возможность использования нового регуляторного элемента клетки — сенсорных РНК для модуляции активности целевых генов и направленной реконструкции бактериального метаболизма
2. Результаты работы по I этапу:
Построена модель вторичной структуры сенсорной РНК rib-оперона с использованием алгоритма Цукера-Тернера. Методами химического и энзиматического пробинга сенсорной РНК rib-оперона определен ее фолдинг и идентифицированы структуры, существенные для связывания молекул метаболитов-эффекторов. Получена коллекция мутаций в лидерной области rib-оперона с измененной регуляцией в отношении негативного действия фолатов. Изучена экспрессия модельных генов rib-оперона и pubE на фоне различных мутаций, затрагивающих активность соответствующих сенсорных РНК.
Изучить возможность использования нового регуляторного элемента клетки — сенсорных РНК для модуляции активности целевых генов и направленной реконструкции бактериального метаболизма
2. Результаты работы по I этапу:
Построена модель вторичной структуры сенсорной РНК rib-оперона с использованием алгоритма Цукера-Тернера. Методами химического и энзиматического пробинга сенсорной РНК rib-оперона определен ее фолдинг и идентифицированы структуры, существенные для связывания молекул метаболитов-эффекторов. Получена коллекция мутаций в лидерной области rib-оперона с измененной регуляцией в отношении негативного действия фолатов. Изучена экспрессия модельных генов rib-оперона и pubE на фоне различных мутаций, затрагивающих активность соответствующих сенсорных РНК.
2
01.08.2007 - 31.10.2007
1. Цель II этапа работы:
Осуществить перенос мутаций в лидерной области rib-оперона в геном полученного ранее штамма-продуцента рибофлавина B. subtilis Y25. Изучить продуктивность полученных штаммов с модифицированной сенсорной РНК в условиях ферментации. Оценить возможность создания конкурентоспособной технологии производства рибофлавина на основе полученных продуцентов.
2. Результаты работы по II этапу:
Осуществлен перенос мутаций в лидерной области rib-оперона в геном полученного ранее штамма-продуцента рибофлавина B. subtilis Y25. Показано, что внесение ряда мутаций в лидерной области rib-оперона в геном этого штамма приводит к повышению продукции рибофлавина на 10-30%. Оптимизированы условия ферментации штаммов-продуцентов рибофлавина B. subtilis Y25, содержащих дополнительные мутации в лидерной области rib-оперона. Проведена оценка возможности создания конкурентоспособной технологии производства рибофлавина на основе полученных продуцентов. Проведен дополнительный патентный поиск в соответствии с ГОСТ Р15.011-96. Сделано заключение, что полученные в ходе работы штаммы являются перспективными для создания конкурентоспособной, ресурсосберегающей и эффективной технологии микробиологического синтеза рибофлавина.
Осуществить перенос мутаций в лидерной области rib-оперона в геном полученного ранее штамма-продуцента рибофлавина B. subtilis Y25. Изучить продуктивность полученных штаммов с модифицированной сенсорной РНК в условиях ферментации. Оценить возможность создания конкурентоспособной технологии производства рибофлавина на основе полученных продуцентов.
2. Результаты работы по II этапу:
Осуществлен перенос мутаций в лидерной области rib-оперона в геном полученного ранее штамма-продуцента рибофлавина B. subtilis Y25. Показано, что внесение ряда мутаций в лидерной области rib-оперона в геном этого штамма приводит к повышению продукции рибофлавина на 10-30%. Оптимизированы условия ферментации штаммов-продуцентов рибофлавина B. subtilis Y25, содержащих дополнительные мутации в лидерной области rib-оперона. Проведена оценка возможности создания конкурентоспособной технологии производства рибофлавина на основе полученных продуцентов. Проведен дополнительный патентный поиск в соответствии с ГОСТ Р15.011-96. Сделано заключение, что полученные в ходе работы штаммы являются перспективными для создания конкурентоспособной, ресурсосберегающей и эффективной технологии микробиологического синтеза рибофлавина.
Программа
Программа "Исследования и разработки по приоритетным направлениям развития научно-технологического комплекса России на 2007-2013 годы"
Программное мероприятие
1.2 Проведение проблемно-ориентированных поисковых исследований и создание научно-технического задела по технологиям в области наук о жизни
Продолжительность работ
2007, 8 мес.
Бюджетные средства
4,1 млн
профинансировано
профинансировано
Продолжительность работ
2007, 8 мес.
Бюджетные средства
4,5 млн
Организация
Томский государственный университет, НИ ТГУ, ТГУ
профинансировано
профинансировано
Продолжительность работ
2007, 8 мес.
Бюджетные средства
4,5 млн
Организация
Томский государственный университет, НИ ТГУ, ТГУ
профинансировано